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快速cmprsk

swMATH ID: 28753
软件作者: Eric S Kawaguchi、Jenny I Shen、Gang Li、Marc A Suchard
描述: 使用R包fastcmprsk快速、可扩展地实现竞争风险数据的方法。医学信息学工具和高通量生物实验的进步使研究人员可以定期访问大规模生物医学数据。竞争风险数据在生物医学研究中是典型的,在生物医学研究中,个体面临多个原因(事件类型)的风险,这可能会阻止其他原因的发生。Fine-Gray模型是一种广受欢迎的竞争风险数据模型,目前已在许多统计软件包中实现。然而,当前的实现在计算上无法扩展大规模竞争风险数据。我们开发了一个R包fastcmprsk,它使用一种新的前向-后向扫描算法,通过利用特定主题风险集的结构,显著降低参数估计的计算复杂性。数值研究将我们的实现速度和可扩展性与当前用于非规范化和惩罚精细灰色回归的方法进行了比较,并显示了计算效率的显著提高。
主页: https://arxiv.org/abs/1905.07438
依赖项: R(右)
关键词: arXiv_状态.CO;R(右);R包;精细灰色模型;逆感应概率;大规模数据;可扩展的计算;半参数化建模;生存分析;时间到事件数据
相关软件: crrSC公司;crrp公司;do并行;crrstep(第一步);cmprsk公司;计时器;风险回归;R(右)
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标准条款

1出版物描述软件 年份
基于R包fastcmprsk的竞争风险数据快速可扩展实现方法arXiv公司
Eric S Kawaguchi、Jenny I Shen、Gang Li、Marc A Suchard
2019