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Aevol公司

swMATH ID: 40802
软件作者: 贝瑞妮斯·巴图特、大卫·帕森斯、斯蒂芬·菲舍尔、纪尧姆·贝斯隆、卡罗尔·尼克布
描述: Aevol-一个电子实验进化平台。Aevol是一个开源数字遗传学平台,它使用遗传算法和基于个体的建模捕捉进化过程。Aevol中的数字生物繁殖、竞争和变异,在典型的达尔文动力学下进化了数十万代。生活在大量人口中的个体在生态和进化时间尺度上相互作用,使我们能够研究通常实验上无法实现的场景,因为我们可以直接控制和改变选择的特征(例如人口规模、环境类型、环境变化)或变异(例如突变和重排的类型和速率,水平转移)。受细菌基因组学和实验微生物进化研究的启发,Aevol拥有一个详细而现实的基因组模型,其特征是潜在的不同数量的基因、遗传结构和编码/非编码序列比例。Aevol集成了一套用于系统发育重建和分析的工具,以及在进化过程中对种群和生物体特性的可视化和表征。模型的扩展(R-Aevol)包含基因表达调控的显式模型,从而允许研究基因调控网络的进化
主页: 网址:http://www.aevol.fr
源代码:  https://gitlab.inria.fr/aevol/aevol
相关软件: 埃塞特拉;INDELible(索引);ALF公司;SimPhy公司
引用于: 2文件
其他出版物: http://www.aevol.fr/publications网站/

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