FM-轨道 swMATH ID: 39479 软件作者: Lejeune E.、Khang A.、Sansom J.、Sacks M.S。 描述: FM-Track:用于在三维环境中研究细胞力学的基准标记跟踪软件。追踪嵌入在顺应性合成或生物凝胶中的活细胞附近基准标记的变形是研究三维环境中细胞力学和机械生物学的有力手段。然而,目前用于跟踪和量化三维(3D)基准标记位移的方法仍然是临时性的,可能难以实施,并且可能无法产生可靠的结果。在此,我们提供了一个名为“FM-Track”的紧凑软件包,该软件包使用流行的Python语言编写,用于促进基于特征的粒子跟踪,该粒子跟踪是为3D细胞微机械环境研究量身定制的。FM-Track包含预处理图像、运行基准标记跟踪、后处理和可视化的功能。因此,FM Track可以通过提供一个可扩展的软件平台来更可靠地提取透明柔顺凝胶系统中复杂的局部3D细胞收缩信息,从而有助于细胞力学和机械生物学的研究。 主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S2352711019303474 源代码: https://github.com/elejeune11/FM-Track网站 依赖项: 蟒蛇 关键词: 软件X;粒子跟踪;基准标记;开源软件;牵引力显微镜;细胞力学;蟒蛇 相关软件: 稀土;派维斯塔;马特普洛特利布;scikit-图像;Scikit公司;动态遮罩;蟒蛇;DIP图像;iso2网格;ABAQUS公司;自由Fem++;SuiteSparseQR套件;ParaView视图;Elastix公司;TFM公司;tfm公司;弗兰克实验室;规范化工具;mpiv公司;Matlab公司 引用于: 0个文档 标准条款 1出版物描述软件 年份 FM-Track:一个用于在三维环境中研究细胞力学的基准标记跟踪软件链接Lejeune E.、Khang A.、Sansom J.、Sacks M.S。 2020