MASTOR公司 swMATH ID: 23134 软件作者： Jakobsdottir J，McPeek理学硕士 说明： 硕士：样本中数量性状与相关个体的关联测试，考虑协变量和缺失数据。MASTOR是一个C程序，它对具有已知相关性的样本中的定量特征进行混合模型关联测试，允许协变和缺失数据。本项目的主要参考文献是Jakobsdottir J.、McPeek M.S.2013《与相关个体样本中数量性状的混合模型关联图》，《美国人类遗传学杂志》92（5）：625-666：遗传关联研究通常对已知家族关系的个体以及无关个体进行样本，一些个体的数据缺失（表型、基因型或协变量）是很常见的。当样本中的某些个体相互关联时，可以通过将所有个体（包括部分缺失数据的个体）纳入分析中来获得权力，同时适当考虑他们之间的依赖性。我们建议使用MASTOR，一种混合模型的回顾性得分测试，用于研究数量性状的遗传关联。MASTOR通过充分利用关系信息将部分缺失的数据纳入分析中，同时纠正依赖性，从而在包含相关个体的样本中获得更高的功效。由于基因型之间的依赖性，具有可用表型和协变量信息但没有基因型但在样本中有基因型亲属的个人仍然可以参与关联分析。同样，基因分型但缺少协变量或表型信息的个体也可以参与分析。MASTOR是有效的，即使表型模型是错误的，并且是随机的或基于表型的确定。在模拟中，我们证明了MASTOR的正确类型1错误、充分利用关系信息所带来的功率增加、表型模型对错误指定的鲁棒性，以及建模遗传率所带来的功耗改进。我们表明，MASTOR在全基因组关联研究中具有计算可行性和实用性。我们将MASTOR应用于弗雷明汉心脏研究的高密度脂蛋白胆固醇数据。 主页： https://www.stat.uchicago.edu/~mcpeek/software/MASTOR/index.html 相关软件： GCTA公司;打开DMAP;NoFold公司;卡纳;记录仪;RNA集群;IgRepertoire构造函数;GraphClust（图形俱乐部）;RNA表面;Rnall公司;梅维;RNA链;格拉维斯托;墨卡托;INDDGO公司;树向导;星形底座;LocARNA扫描;COMPASS（指南针）;Pfam公司 引用于： 2文件 全部的 前5名6位作者引用 1 迪班卡Bandyopadhyay 1 关婷 1 乔纳森·基思（Jonathan M.Keith）。 1 路易斯·诺维罗（Luis G.León-Novelo）。 1 刘大江J。 1 吴晓伟 2篇连载文章中引用 1 应用统计学年鉴 1 分子生物学方法 在3个字段中引用 2 生物学和其他自然科学（92-XX） 1 总体主题；集合（00-XX） 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文