MOIL公司 swMATH ID: 35737 软件作者: 埃尔伯,R。;Roitberg,A。;Simmerling,C。;Goldstein,R。;李,H。;Verkhivker,G。;基萨尔,C。;张杰。;A.乌利茨基。 描述: MOIL:模拟大分子的程序。描述了分子动力学模拟的计算机程序包-MOIL。灵活的数据结构使得能够研究具有与AMBER/OPLS力场一致的电势的大分子。提供的参数集考虑了蛋白质。除了能量、能量最小化、正常模式、动力学和自由能计算等“广泛应用”之外,还提供了代码,以实现不太常见的应用。这包括反应路径计算(在凝聚相中)、平均场方法用于增强采样(LES-增强采样)以及使用Landau-Zener模型计算曲线交叉。对整个计划进行了简要回顾。对几个模块进行了相当详细的讨论。 主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/001046559500047J 相关软件: NAMD2型;STL公司;磁粉探伤;OOMPAA公司 引用于: 2文件 由4位作者引用 1 罗恩·埃尔伯 1 加里·胡贝尔(Gary A.Huber)。 1 J.Andrew McCammon 1 耶尔·温巴赫 连载1篇 2 计算物理杂志 在2个字段中引用 1 计算机科学(68至XX) 1 统计力学,物质结构(82-XX) 按年份列出的引文