SSW库 swMATH ID: 33167 软件作者： 赵梦瑶、李万平、埃里克·加里森、加博尔·马思 描述： SSW库：用于基因组应用的SIMD Smith-Waterman C/C++库。Smith-Waterman（SW）算法产生两个序列之间的最佳成对比对，经常被用作快速启发式读取映射和变异检测工具的关键组件，但当前的实现要么被设计为单片蛋白质数据库搜索工具，要么被嵌入到其他工具中。为了便于将快速单指令多数据（SIMD）软件算法轻松集成到第三方软件中，我们编写了一个C/C++库，该库扩展了Farrars Striped SW（SSW），以在最佳SW分数之外返回对齐信息。可用性：SSW既可用作C/C++软件库，也可用作包装库功能的独立对齐工具，网址为https URL Striped-Smith-Waterman-library Contact:马特@bc.edu 主页： https://arxiv.org/abs/1208.6350 关键词： 基因组学;arXiv_q-bio.GN;史密斯·沃特曼（SW）;基因组应用;C/C++库;Farrars条纹SW 相关软件： 基因优化器;肌肉 引用于： 0个文档