sPuReMD公司 swMATH ID: 12865 软件作者: 阿图尔加、哈桑·梅廷;潘迪特,萨加尔·A。;Adri C.T.Van Duin。;阿南斯·格拉玛。 描述: 反应分子动力学:数值方法和算法技术。。本文介绍了sPuReMD(串行Purdue反应分子动力学程序)的实现细节,这是一个独特的反应性经典MD代码。我们描述了各种数据结构,以及模拟引擎核心的电荷平衡求解器。这个Krylov子空间解算器依赖于一个基于带阈值的不完全LU因式分解(ILUT)的预条件器,专门针对我们的应用程序。我们全面验证了sPuReMD在各种碳氢化合物系统上的性能和准确性。特别是,我们显示出良好的每一步时间、系统大小的线性时间缩放和低内存占用。sPuReMD是一个具有GPL的自由分布软件,目前正用于建模各种系统,从生物膜中的氧化应激到Si-Ge纳米棒中的应变弛豫。 主页: http://epubs.siam.org/doi/ref/10.1137/100808599 相关软件: 雷克斯FF;PuReMD公司;NAMD公司;CUDA公司;车灯;Gromacs公司;奥维托;ILUT公司;QHD泡沫;MPI公司;PSPIKE公司;德斯蒙德 引用于: 5文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 反应分子动力学:数值方法和算法技术。 Zbl 1387.65128号哈桑·梅廷·阿克图加;萨加尔·潘迪特。;阿德里·C·T·范·杜恩。;阿南斯·格拉玛。 2012 全部的 前5名14位作者引用 三 哈桑·梅廷·阿克图加 2 阿南斯·格拉玛。 1 阿卜杜拉·阿尔佩伦 1 陈强 1 苏迪尔·凯拉萨。 1 库尔特·奥赫恩。 1 萨加尔·潘迪特(Sagar A.Pandit)。 1 马雷克·杰尔兹·平德拉 1 Viktoria O·波德里加。 1 谢尔盖·波利亚科夫。 1 D.V.普兹尔科夫。 1 孙瑜 1 阿德里·C·T·凡·杜恩。 1 王冠南 4篇连载文章中引用 2 SIAM科学计算杂志 1 计算物理杂志 1 欧洲力学杂志。A.固体 1 洛巴切夫斯基数学杂志 全部的 前5名在7个字段中引用 三 数值分析(65-XX) 1 计算机科学(68至XX) 1 粒子和系统力学(70-XX) 1 可变形固体力学(74-XX) 1 流体力学(76-XX) 1 量子理论(81-XX) 1 统计力学,物质结构(82-XX) 按年份列出的引文