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iPPI-PseAAC公司

swMATH ID: 27665
软件作者: 贾,J。;李,X。;邱,W。;Xiao,X。;周,K.-C。
描述: iPPI-PseAAC(CGR):通过将混沌游戏表示纳入PseAAC来识别蛋白质相互作用。对蛋白质-蛋白质相互作用网络(PPIs)的研究将为细胞的内部工作提供有价值的见解。因此,开发一种能够有效预测PPI的自动化方法或高通量工具至关重要。在本研究中,通过将“混沌博弈表征”信息纳入伪氨基酸组成(PseAAC),开发了一种新的预测因子“iPPI-PseAAC(CGR)”。这样做的优点是在处理蛋白质对样品期间可以更有效地结合一些关键序列顺序或序列模式信息。此预测器中使用的操作引擎是随机森林算法。通过对广泛使用的基准数据集进行交叉验证,我们发现,所提出的预测值的成功率显著高于现有预测值。为了方便大多数实验科学家,已经在http://www.jci-bioinfo.cn/iPPI-PseAAC(CGR),用户无需经过详细的数学计算即可轻松获得所需的结果。
主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/pii/S0022519318304971
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