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PFCorr公司

swMATH ID: 14194
软件作者: Chandrajit巴贾杰;鲍尔,贝内迪克特;拉达克里什纳·贝塔达普拉;安捷·沃尔拉斯
描述: 刚体和多维旋转关联的非均匀傅里叶变换。评估相关性的任务是计算结构生物学的核心。刚体相关问题寻求刚体变换(R,t),R∈SO(3),t∈SO(3)它最大化了代表分子结构的一对输入标量值函数之间的相关性。刚体相关问题的穷举解利用快速傅立叶变换来实现相对于所寻求的平移或旋转的加速。针对刚体相关问题,我们提出了基于非等间距SO(3)傅里叶变换的PF corr,一种新的穷举解;与以前的解决方案不同,我们实现了平移和旋转加速的组合,而不需要等间距网格。PF-corr可以直接应用于蛋白质结构预测和精细化中的各种问题,这些问题涉及蛋白质刚性运动下的相关性。此外,我们还展示了它如何与适当的柔韧性模型一起应用于与蛋白质柔韧性相关的上述问题的类似物。
主页: http://cvcweb.ices.utexas.edu/cvcwp/?page_id=2353
关键词: 快速傅里叶方法;刚体运动;匹配并适合;详尽搜索;快速相关
相关软件: NFFT3型;洛姆;MTEX公司;切布芬2;切布冯;F2码头;ZDOCK公司;奇梅拉;名称2;西特斯
引用于: 3文件

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