MoVisPP公司 swMATH ID: 35665 软件作者: 陈明;哈里哈拉普特兰,斯里达尔;霍菲斯特•德(Hofestädt),拉尔夫(Ralf);本杰明·科尔迈耶 描述: MoVisPP是一个基于网络的工具,使用Petri网对生化途径进行建模和可视化。大规模生物网络半自动构建的Petri网模型。对于虚拟细胞的实现,根本问题是如何对复杂的生物网络进行建模和模拟。在过去的15年中,Petri网吸引了越来越多的关注,以帮助解决这个关键问题。关于已发表的论文,很明显,混合功能Petri网是建模复杂生物网络的适当方法。如今,生物网络的Petri网模型是通过用鼠标事件绘制位置、过渡和弧来手动构建的。因此,基于相关分子数据库和信息系统的生物数据集成是构建生物网络的关键步骤。我们推动了Petri网在生物网络建模和仿真中的应用。此外,我们还提供了一种对相关代谢数据库(如KEGG、BRENDA等)的访问方式。基于此集成过程,系统支持相关混合Petri网模型的半自动生成。本文还介绍了心脏病相关基因调控生物网络的案例研究。MoVisPP网址为{网址:http://agbi.techfak.uni-bilefeld.de/movispp/}. 主页: http://agbi.techfak.uni-bielefeld.de/movispp网站/ 关键词: 函数Petri网;模型构造;数据集成;心病网络;MoVisPP公司 相关软件: 清爽;科帕西;虚拟单元格;VisANT公司;生物-SPICE;KEGG公司;电子电话;GEPASI公司;斯特拉;SCAMP公司;伦敦银行支持向量机;DSSZ-MC公司 引用于: 3文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物在zbMATH中 年份 大规模生物网络半自动构建的Petri网模型。 Zbl 1251.92012年陈明;斯里达尔·哈里哈拉普特兰;拉尔夫·霍菲斯特;本杰明·科尔迈耶 2011 全部的 前5名7位作者引用 1 科里·J·布茨。 1 大卫·吉尔伯特 1 斯里达尔·哈里哈拉普特兰 1 莫妮卡·海纳 1 拉尔夫·霍菲斯特 1 本杰明·科尔迈耶 1 帕万林格拉斯 2篇连载文章中引用 1 理论计算机科学 1 自然计算 在3个字段中引用 三 计算机科学(68-XX) 2 生物学和其他自然科学(92-XX) 1 统计学(62-XX) 按年份列出的引文