网络网关 swMATH ID: 21512 软件作者： Pariya Behrouzi，Ernst C.Wit 描述： netgwas：基于网络的全基因组关联研究的R包。图形模型提供了强大的工具，可以对多元数据中变量之间的复杂关系进行建模和统计推断。它们广泛用于统计和机器学习，尤其是分析生物网络。在本文中，我们介绍了R包netgwas，它是为实现遗传学中三个重要且相互关联的目标而设计的：连锁图构建、重建染色体内和染色体间的相互作用以及探索高维基因型-表型（和基因型-表现型-环境）网络。netgwas包能够处理任何倍性水平的物种。该软件包实现了在连锁图构建方面的最新改进（Behrouzi和Wit，2017b），以及在推断非高斯、离散和混合数据的条件独立网络方面（Behrouzi和Wit，2017a），特别是在基因型-表型数据集方面。该软件包使用多核处理器上的并行化策略来加速大型数据集的计算。此外，它还包含几个用于模拟和可视化的函数，以及三个来自文献的多元示例数据集，用于说明软件包的功能。本文简要概述了软件包中实施的统计方法。论文的主体部分解释了如何使用包装。此外，我们用实际示例说明了包的功能。 主页： https://cran.r-project.org/web/packages/netgwas/index.html 源代码： https://github.com/cran/netgwas网址 依赖项： 对 关键词： 应用；arXiv统计.AP；生物分子；arX病毒q-bio.BM；基因组学；arXiv q-bio.GN；分子网络；arXiv q-bio.MN；人口与进化；arXiv q-bio.PE公司；arXiv公司；墨迹图构建；连锁不平衡；上位；基因型-表型网络；基因型-表型-环境网络；无方向图形模型；高斯联结；R包 相关软件： 矩阵；对；一幅地图；藤架；卢比/夸脱；记录仪；沃盖姆；ASMap（美国地图）；动态地图；质量（R）；Rbgl公司；地图制作者；ssgraph（ssgraph）；巨大的；bn学习；pcalg公司；玻璃制品；LAPACK公司；BD图表 引用于： 1文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 netgwas：基于网络的全基因组关联研究的R包链接巴黎贝鲁齐；阿伦兹，丹尼；Ernst C.Wit先生。 2022 5位作者引用 1 丁俊华 1 李奇斋 1 王金娟 1 薛、袁 1 张三国 连载1篇 1 遗传学和分子生物学中的统计应用 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文