抗SMASH swMATH ID: 17019 软件作者： Marnix H.Medema、Kai Blin、Peter Cimermancic、Victor de Jager、Piotr Zakrzewski、Michael A.Fischbach、Tilmann Weber、Eriko Takano、Rainer Breitling 描述： 抗SMASH：细菌和真菌基因组序列中次生代谢产物生物合成基因簇的快速鉴定、注释和分析。细菌和真菌的次生代谢是新型生物活性化合物的丰富来源，在抗生素、抗肿瘤药物或降胆固醇药物等方面具有潜在的药物应用前景。为了寻找新的候选药物，微生物学家越来越依赖于对各种微生物的基因组进行测序。然而，由于生物化学异质性、未知酶的存在以及必要的专业生物信息学工具和资源的分散性，快速可靠地确定数十个新测序基因组中次级代谢物的所有潜在基因簇一直极具挑战性。这里，我们介绍抗SMASH（抗生素和次级代谢产物分析外壳），第一条能够识别涵盖所有已知次级代谢产物化合物类别的生物合成位点的综合管线（聚酮类、非核糖体肽、萜烯类、氨基糖苷类、氨基香豆素类、吲哚咔唑类、植物双药、细菌素类、核苷类、β-内酰胺类、丁内酯类、铁载体、黑色素类等）。它将基因簇水平上的已识别区域与包含所有其他已知基因簇的数据库中的最近亲进行比对，并在一个交互视图中整合或交联所有先前可用的二级分子筛特定基因分析方法。antiSMASH可在http://antismash.secondarmetamabolites.org。 主页： http://nar.oxfordjournals.org/content/39/suppl_2/W339.short 相关软件： 剂量;阿波罗;DBAli工具;MATRAS公司;NUCPLOT公司;LIGPLOT公司;EMBOS公司;焦耳（Jmol）;PhenomeNET公司;智能GO;Ontobee公司;函数;Aber-OWL公司;工厂TFDB;鸡蛋NOG;ELM公司;数据库CAN;解剖HMMER;HPMV（高压中压）;安妮 引用于： 1文件 2位作者引用 1 卡鲁戈语、奥利维埃罗语 1 弗兰克·艾森哈伯 连载1篇 1 分子生物学方法 在2个字段中引用 1 统计学（62-XX） 1 生物学和其他自然科学（92-XX） 按年份列出的引文