Mdtraj公司 swMATH ID: 22742 软件作者: R.T.McGibbon、K.A.Beauchamp、M.P.Harrigan、C.Klein、J.M.Swails、C.X.Hernández、C.R.Schwantes、L.P.Wang、T.J.Lane、V.S.Pande 描述: Mdtraj:用于分析分子动力学轨迹的现代开放库。只需几行Python代码即可阅读、编写和分析MD轨迹。使用MDTraj,您可以从任何可以想象的MD格式(pdb、xtc、trr、dcd、binpos、netcdf、mdcrd、prmtop…)进行读写操作,运行速度极快的RMSD计算(是原始Theobald QCP的4倍)。使用大量分析功能,如键/角/二面体、氢键识别、二级结构赋值、核磁共振观察。使用轻量级API,重点关注速度和矢量化操作。有关详细信息,请参阅mdtraj.org网站。要参与其中,请查看github问题跟踪器和/或用户论坛discusse.mdtraj.org。 主页: https://github.com/mdtraj/mdtraj 源代码: https://github.com/mdtraj/mdtraj 相关软件: 蟒蛇;车灯;供应商管理部;开放式多媒体;格鲁马克斯;PyMOL公司;D订阅;ESPResSo公司;ESPResSo公司++;奥维托;原子;HOOMD蓝色;Scikit公司;聚会;炊具;CPPTRAJ公司;pdb工具;插塞式;PyTraj公司;MD分析 引用于: 1文件 4位作者引用 1 Itoh,Satoru G。 1 乔瓦尼·拉佩纳 1 久岛大村 1 Masataka Yamauchi 连载1篇 1 计算机物理通信 在2个字段中引用 1 量子理论(81-XX) 1 统计力学,物质结构(82-XX) 按年份列出的引文