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2023年质量管理手册

swMATH ID: 46777
软件作者: 林,海;张燕;索鲁什·佩泽什基;亚当·达斯特(Adam W.Duster)。;王波;吴新平;郑世文;Laura Gagliardi;唐纳德·特鲁勒。
描述: QMMM 2023:量子力学和分子力学联合建模和模拟程序。量子力学和分子力学(QM/MM)相结合的方法在多尺度建模和模拟中发挥着重要作用。2023年质量管理手册是一个通用程序,用于QM/MM级别的单点计算、几何优化、过渡态优化和分子动力学(MD)。它调用QM包和MM包来执行所需的单级计算,并通过各种方案将它们组合成QM/MM能量。2023年质量管理手册支持GAMESS-US,高斯和ORCA作为QM包补锅匠作为MM包。在MM环境中嵌入QM子系统有四种处理方式:机械嵌入QM区域的气相计算,电子嵌入允许MM环境极化QM区域,极化嵌入QM和MM区域的相互极化,以及用于QM和MM区域之间的相互极化和部分电荷转移的柔性嵌入。通过共价键的QM和MM区域之间的边界可以用几种方法处理,包括重新分配电荷(RC)方案、重新分配电荷和偶极(RCD)方案、平衡RC方案、平衡RCD方案、考虑电荷穿透效应的屏蔽电荷方案、,以及分散电荷方案,该方案使MM电荷在QM-MM边界附近非定域。可以使用中实现的优化器进行几何优化2023年质量管理手册或中的Berny优化器高斯通过外部调用高斯分子动力学模拟可以在纯MM水平、纯QM水平、固定划分QM/MM水平和自适应划分QM/MM水平上进行。自适应分区处理允许通过动态地将原子或组重新分类到QM或MM子系统中来实时重新定位QM-MM边界。
主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0010465523003326
依赖项: Fortran90,Perl语言
关键词: 自适应分区柔性边界极化边界QM-MM边界重分布电荷和偶极子调谐平衡边界
相关软件: OpenMolcas公司GAMESS公司琥珀色Q-Chem公司ORCA公司高斯人修补
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1 量子理论(81-XX)

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