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PNPSIC公司

swMATH ID: 44876
软件作者: 谢德轩;赵、珍
描述: 泊松-能斯特-普朗克单离子通道模型及其有效的有限元求解器。单离子通道是一种带有离子选择性过滤器的膜蛋白,它只允许单一种类的离子(例如钾离子)以“开放”状态通过。其选择性过滤器也自然地将溶剂域分离为细胞内域和细胞外域。本文将单离子通道的这种生物和几何特性新颖地用于构建一种新型的介质连续离子通道模型,称为泊松-能斯特-普朗克单离子通道(PNPSIC)模型。然后,开发并实现了一个有效的PNPSIC有限元解算器,该软件包可用于具有三维X射线晶体分子结构和多种离子混合物的单离子通道。钾离子通道的数值结果证实了PNPSIC有限元求解器的收敛性和效率,并证明了软件包的高性能。此外,将PNPSIC模型应用于电流计算,并通过生物物理实验数据进行了验证
主页: https://www.sciencedirect.com/science/article/abs/pii/S0021999123001389
依赖项: 蟒蛇;Fortran公司
关键词: 泊松-能斯特-普朗克方程;有限元法;单离子通道;钾离子通道;电流计算
相关软件: FEniCS公司;nuSMPBIC公司;TMSmesh公司;TetGen公司;MolSurf公司;蟒蛇;ParaView视图;MIBPB公司;SMPBS公司;APBS公司;WebPlot数字转换器
引用于: 6文件

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