PBTK优化器 swMATH ID: 38421 软件作者： Edhlund，I。；麦考利，M。；C.李。 描述： PBTK Optimizer:Python中PBTK模型参数优化的开源应用程序。鱼类基于生理学的毒代动力学（PBTK）模型在环境风险评估中具有很大的前景，有可能加快剂量反应研究，同时尽量减少动物试验。PBTK模型通常写为常微分方程（ODE），最近用Petri网建模。PBTK领域存在一些局限性，例如模型开发困难，缺乏帮助建模人员的特定应用软件工具。为了解决其中的一些限制，我们引入了PBTK Optimizer，这是一种用于优化Petri网PBTK模型参数的开源工具。该软件通过之前发布并验证的彩虹鳟鱼荧蒽暴露PBTK模型进行了演示。我们使用PBTK Optimizer进行了案例研究，以评估模型的不同参数。关于本软件中使用的优化方法的Python代码和结论可能适用于PBTK建模以外的ODE应用程序。 主页： https://openresearchsoftware.metajnl.com/articles/10.5334/jors.285/ 源代码： https://github.com/ianedhlund/PBTK优化器/ 依赖项： 蟒蛇 关键词： 开放研究软件杂志；PBTK优化器；微分方程；ODE模型；基于生理学的；毒代动力学模型；PBTK公司；最优化；Petri网；蟒蛇 相关软件： 马特普洛特利布；数字Py；LMFIT公司；清爽；蟒蛇 引用于： 0个文档 标准条款 1出版物描述软件 年份 PBTK优化器：Python中PBTK模型参数优化的开源应用程序链接Edhlund，I。；麦考利，M。；C.李。 2021