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CGH功率

swMATH ID: 35237
软件作者: 谢伊宁,I.,J.费雷拉,S.克努提拉,G.梅耶尔,M.范德维尔,B.伊尔斯特拉
描述: CGHpower:探索染色体拷贝数实验的样本量计算。结果:在这里我们探索了比较两组aCGH实验的功率计算。在一个试点实验中,CGHpower估计了群体之间的生物多样性,并提供了一个统计框架,用于估计作为样本大小函数的平均功率。由于该方法需要试验数据,因此可以用于大型研究的规划阶段,也可以用于估计过去实验中获得的功率。结论:提出的方法依赖于某些假设。根据我们对公共数据集和模拟数据集的评估,它们并不总是正确的。违反假设通常会导致不可靠的样本量估计。尽管有其局限性,但至少就我们所知,该方法是目前在aCGH环境下进行样本量计算的唯一方法。此外,该方法的实施提供了诊断图,可以对其所基于的假设进行关键评估,从而对每种情况下样本量计算的可行性和可靠性进行评估。CGHpower web应用程序和评估数据集的程序输出可以在http://www.cangem.org/cghpower网站/
主页: https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-11-331
相关软件: R(右);半标准杆;边缘R;生物导体
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