mad-GP公司 swMATH ID: 42206 软件作者: Daniel Huang;滕、冲;鲍俊伟·卢卡斯;Jean-Baptiste,特里斯坦 描述: mad-GP:分子和材料高斯过程的自动微分。在本文中,我们介绍了一个名为mad-GP的Python库,它使用户能够更轻松地探索用于建模势能面(PES)的高斯过程(GP)代理模型的设计空间。mad-GP用户只需写下先验均值函数(即PES的先验猜测)和核函数(即对PES类的约束)的函数形式,库通过自动微分(AD)处理所有需要的导数实现。我们将mad-GP应用于小分子的几何优化,从而验证了其设计。特别是,我们测试了将GP代用品与能量和/或力相匹配的有效性,并对GP-PES代用品中非恒定先验和层次核的使用进行了初步研究。我们发现,适合力的GP与同时适合力和能量的GP的性能相当,尽管只适合力的GPs在优化方面更稳健,因为它们不需要在优化过程中应用额外的步骤。我们还证实了常数平均函数和Matérn核的工作情况与文献中报道的一样好,尽管我们的测试也确定了其他几个有希望的候选函数(例如,具有三倍可微Maté)。我们的测试验证了AD是用GP替代模型对小分子进行几何优化的可行方法。 主页: https://link.springer.com/article/10.1007/s10910-022-01334-x 依赖项: 蟒蛇 相关软件: D订阅;github;DiffSharp(差异锐化);鸬鹚;多模式;PhysNet(物理网);SchNet公司;日本宇宙航空公司;ASE公司;SchNetPack(SchNetPack);蟒蛇;POTLIB公司;科学Py 引用于: 1文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 mad-GP:分子和材料高斯过程的自动微分。 Zbl 1491.92142号丹尼尔·黄;腾、冲;鲍俊伟卢卡斯;Jean-Baptiste,特里斯坦 2022 3位作者引用 1 鲍俊伟卢卡斯 1 腾、冲 1 Jean-Baptiste,特里斯坦 连载1篇 1 数学化学杂志 在2个字段中引用 1 概率论与随机过程(60-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文