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GillespieSSA公司

swMATH ID: 21016
软件作者: 马里奥·派尼达-科赫
描述: R包GillespieSSA:Gillespie的随机模拟算法(SSA)。GillespieSSA为几种随机模拟算法提供了一个简单易用、直观且可扩展的接口,用于生成有限人口连续时间模型的模拟轨迹。目前,它实现了Gillespie的精确随机模拟算法(直接法)和几种近似方法(显式τ-leap、二项式τ–leap和优化τ–eap)。该包还包含一个模板模型库,这些模型可以作为演示模型运行,并且可以很容易地进行自定义和扩展。目前包括以下模型:衰变二聚反应集、线性链系统、logistic增长模型、Lotka捕食-食饵模型、Rosenzweig-MacArthur捕食-被捕食模型、Kermack-McKendrick SIR模型和集合种群SIRS模型。
主页: https://cran.r-project.org/web/packages/GillespieSSA/index.html
源代码:  https://github.com/cran/GillespieSSA网站
依赖项:
相关软件: ;解算;朱莉娅;Gillespie.jl公司;simecol公司;科帕西;生物净发电;InterSpread Plus公司;蟒蛇;EpiContactTrace(接触跟踪);记录仪;重塑;Epigrass公司;ggplot2;foreach公司;do并行;混合模型;工具箱;nlmeODE(非本地ODE);ReacTran公司
引用于: 4文件

标准条款

1出版物描述软件 年份
GillespieSSA:在R中实现Gillespie随机模拟算法链接
马里奥·派尼达-科赫
2008

按年份列出的引文