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multtest公司

swMATH ID: 8262
软件作者: 凯瑟琳·波拉德(Katherine S.Pollard)、休斯顿·N·吉尔伯特(Houston N.Gilbert)、葛永超(Yongchao Ge)、桑德拉·泰勒(Sandra Taylor)、桑德琳·杜多特(Sandrine Dudoit)
描述: multtest:基于重采样的多重假设测试。基于非参数自举和置换重采样的多重测试程序(包括经验贝叶斯方法),用于控制家族错误率(FWER)、广义家族错误率、假阳性比例的尾部概率(TPPFP)和假发现率(FDR)。实现了几种基于引导的空分布选择(居中、居中和缩放、分位数转换)。可采用单步法和分步法。包括基于各种t-和F-统计量的测试(包括基于线性和生存模型回归参数的t-统计量,以及基于相关参数的t-统计量)。当使用t-统计量探测假设时,用户还可以选择一个可能更快的零分布,该零分布是多元正态分布,均值为零,方差协方差矩阵由向量影响函数导出。结果根据调整后的p值、置信区间和检验统计截止值进行报告。该程序可直接应用于鉴定DNA微阵列实验中差异表达的基因。
主页: http://www.bioconductor.org/packages/release/bioc/html/multtest.html
依赖项: R(右)
相关软件: R(右);生物导体;全球气候变化评估;q值;录像机;mvtnorm公司;Phyloseq公司;结构SSI;fastICA(快速ICA);质量(R);fda(右);SAS公司;阿菲;GET(获取);单倍统计;SNP统计;SNPassoc公司;Stata公司;SAS/STAT系统;建模工具
引用于: 20文件

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