截面 swMATH ID: 38960 软件作者: 洛林·克劳福德;单音,国歌;陈,安德鲁·X。;穆克吉(Mukherjee,Sayan);劳尔·拉巴丹 说明: 预测胶质母细胞瘤的临床结局:拓扑和功能数据分析的应用。多形性胶质母细胞瘤(GBM)是一种侵袭性人脑肿瘤,目前正在癌症生物学领域进行积极研究。它的快速发展和获得分子数据的相对时间成本使其他易于获得的数据形式,如图像,成为患者可采取措施的重要资源。我们的目标是在统计设置中使用GBM患者的医学图像提供的信息。为此,我们设计了一种新的统计方法——平滑欧拉特征变换(SECT)——用于量化肿瘤的磁共振图像。由于其定义明确的内部产品结构,与其他先前提出的拓扑汇总统计相比,SECT可用于更广泛的功能和非参数建模方法。当应用于GBM患者队列时,我们发现SECT比现有的肿瘤形状定量和常见的分子检测更能预测临床结果。具体而言,我们证明,与基因表达、体积特征和形态特征相比,仅SECT特征更能解释GBM患者存活率的差异。因此,我们研究结果的主要结论是双重的。首先,他们认为图像包含有价值的信息,可以在临床预后和其他医疗决策中发挥重要作用。其次,他们表明,SECT是一个可行的工具,用于更广泛的医学成像信息学研究。 主页: https://arxiv.org/abs/1611.06818 源代码: https://github.com/lorinanthony/SECT网站 依赖项: R;C++;Matlab公司 关键词: 欧拉特性;功能数据;多形性胶质母细胞瘤;形状统计;拓扑数据分析 相关软件: 持久性图像;叫做古迪辛;github;Scikit公司;西纳特拉;科学Py;TDA公司;持久性曲线;t-SNE公司;节点2vec;大Vis;私人电话;净SMF;metatah2vec;DeepWalk公司;线路;深度AR;UMAP公司;铆钉;MRtrix公司 引用于: 17文件 标准条款 1出版物描述软件,包括1出版物以zbMATH为单位 年份 预测胶质母细胞瘤的临床结局:拓扑和功能数据分析的应用。 Zbl 1441.62316号洛林·克劳福德;莫诺德、安提亚;Chen,Andrew X。;赛扬·穆克吉;劳尔·拉巴丹 2020 全部的 前5名51位作者引用 三 约翰·克雷布斯(Johannes T.N.Krebs)。 2 洛林·克劳福德 2 赛扬·穆克吉 2 汤姆·李约瑟 2 沃尔夫冈·波洛尼克 2 本杰明·罗伊克拉夫特 1 雷娜·安德列娃 1 罗宾·林恩·贝尔顿 1 加布里埃尔·贝尔特拉莫 1 尼古拉斯·伯克 1 伯纳乌,米格尔·O。 1 道格拉斯·博伊尔(Douglas M.Boyer)。 1 布鲁蒂,皮尔保罗 1 彼得·布贝尼克 1 Chen,Andrew X。 1 Chung,Moo K。 1 贾斯汀·迈克尔·柯里 1 杜钦,月亮 1 Fasy,Brittany Terese布列塔尼·泰瑞丝 1 高廷然 1 伊列尼亚·贾拉塔诺 1 海滨杭 1 马丁·朱卢姆 1 康健 1 亨利·柯维斯拉蒂 1 李启伟 1 安德斯·罗兰 1 罗斯蒂克·默茨 1 塞缪尔·米卡 1 大卫·L·米尔曼。 1 Mio,华盛顿 1 莫诺德、安提亚 1 月亮,楚宇 1 Okutan、Osman Berat 1 高石小和田 1 塔利亚·帕德利尼 1 劳尔·拉巴丹 1 丹尼尔·萨利纳斯 1 里克·萨卡尔 1 安娜·申菲什 1 约旦舒巴赫 1 普里莫兹·斯卡拉巴 1 Tananun Songdechakraiwut 1 蒂莫西·苏迪约诺 1 安德鲁·托马斯。 1 Tjötheim,Dag B。 1 王小龙 1 托马斯·威吉尔 1 露西娅·威廉姆斯 1 肖光华 1 张黛薇 全部的 前5名12篇连载文章中引用 三 应用统计学年鉴 2 美国统计协会杂志 2 数据科学基础 1 应用概率的进展 1 统计学年鉴 1 统计 1 统计科学 1 计算几何 1 伯努利 1 电子统计杂志 1 数学论坛,西格玛 1 应用与计算拓扑杂志 全部的 前5名在8个字段中引用 12 统计学(62-XX) 8 代数拓扑(55-XX) 4 概率论与随机过程(60-XX) 4 计算机科学(68至XX) 1 交换代数(13-XX) 1 偏微分方程(35-XX) 1 流形和细胞复合体(57至XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文