猫 swMATH ID: 35656 软件作者: 韩瑜、安德鲁·S·尤、伊娃·格林沃尔德 描述: 转录位点聚类分析器(CATS):一个基于C++的程序,用于识别聚集的转录因子结合位点。我们开发了一个程序,即转录位点簇分析器(CATS),它可以识别任何基因组序列中的转录因子结合位点簇。该程序在一个窗口(DNA长度)内搜索DNA结合的一致序列簇。窗口大小和簇大小(给定窗口中一致序列的数量)可以改变。CATS可用于根据生化和突变分析或比较基因组学推导出一致序列的单个或多个转录因子。对不同转录因子结合位点簇使用CATS可能有助于识别以细胞类型特异性或发育阶段特异性方式共同调控的基因。CATS易于在运行任何Windows NT平台的计算机上安装和使用。可利用性:http://www.healthsciences.columbia.edu/dept/greenwaldlab/links.html 主页: https://academic.oup.com/bioinformatics/article/20/7/1198/245738 相关软件: Cis模块 引用于: 1文件 5位作者引用 1 彼得·约翰·比克尔 1 内森·博利 1 詹姆斯·布朗。 1 黄海燕 1 张南希·若南 连载1篇 1 应用统计学年鉴 在3个字段中引用 1 统计学(62-XX) 1 数值分析(65-XX) 1 生物学和其他自然科学(92-XX) 按年份列出的引文