PyBioNetFit公司 swMATH ID: 34668 软件作者： 密特拉，ED；苏德曼，R。；科尔文，J。；艾伦科夫。；胡，A。；索罗，HM；RG波斯纳；拉瓦切克，WS 描述： PyBioNetFit（PyBNF）是一个通用程序，用于参数化使用BioNetGen基于规则的建模语言（BNGL）或系统生物学标记语言（SBML）指定的生物模型。PyBioNetFit提供了一套用于参数优化的并行元启发式算法（差分进化、粒子群优化、分散搜索）。除了模型参数化之外，PyBNF还支持通过引导或贝叶斯方法进行不确定性量化，以及模型检查。PyBNF包括生物特性规范语言（BPSL），用于定义用于参数化或检查的定性数据。它在大多数Linux和macOS工作站以及计算集群上运行。 主页： https://pybnf.readthedocs.io/en/最新/ 源代码： https://github.com/lanl/PyBNF 关键词： 定量方法；arXiv_q-bio.QM；分类数据；正式验证；并行计算；参数识别；基于规则的建模；生物模型 相关软件： 科帕西；阿米戈；碲；MEIGO公司；生物净发电；数据2Dynamics；皮佩斯托；香蒜酱；PEtab公司；日晷；短语SED-ML；CellML手机；R（右）；pyABC公司；SBtab（SBtab）；锑；蟒蛇；达克；PyDREAM公司；被烤焦的 引用于： 1文件 标准条款 1出版物描述软件 年份 PyBioNetFit与生物特性规范语言arXiv公司Eshan D.Mitra、Ryan Suderman、Joshua Colvin、Alexander Ionkov、Andrew Hu、Herbert M.Sauro、Richard G.Posner、William S.Hlavacek 2019 3位作者引用 1 简·哈塞纳尔 1 莱昂纳德·施密斯特 1 丹尼尔·温德尔 连载1篇 1 数学生物学杂志 在2个字段中引用 1 动力系统和遍历理论（37至XX） 1 数值分析（65-XX） 按年份列出的引文