箭头图 swMATH编号： 30012 软件作者： Silva-Fortes，C。；Turkman，M。；苏萨，L。 描述： 箭头图：一种新的图形工具，用于选择上调和下调基因以及样本亚群中差异表达的基因。背景：分析微阵列数据的一个常见任务是确定哪些基因在两种（或多种）组织样本或在实验条件下提交的样本中差异表达。为了实现这一目标，人们提出了几种统计方法，通常基于类间距离的度量。众所周知，由于分子亚型或遗传背景等因素，生物样品是异质的，而实验者往往不知道这些因素。例如，在涉及肿瘤分子分类的实验中，确定重要的癌症亚型很重要。双峰或多峰分布通常反映子样本混合的存在。因此，如果使用通常的统计方法，可能会在样本亚组上遗漏差异表达的基因。在本文中，我们提出了一种新的图形工具，它不仅可以识别具有上下调节的基因，还可以识别不同亚类中差异表达的基因，如果使用当前的统计方法，这些基因通常会被遗漏。该工具基于样本之间距离的两个度量，即两种密度之间的重叠系数（OVL）和接收器工作特性（ROC）曲线下的面积。这里提出的方法是在开源R软件中实现的。 主页： https://bmcbioinformatics.biomedcentral.com/articles/10.1186/1471-2105-13-147 依赖项： R（右） 相关软件： 引导数据库;科恩平滑 引用于： 1文件 2位作者引用 1 田丽丽 1 王，丹 连载1篇 1 计算统计与数据分析 在1个字段中引用 1 统计学（62-XX） 按年份列出的引文