CellDetect：学习检测细胞

卡洛斯·阿尔特塔,维克托·伦皮茨基,艾莉森·诺布尔和安德鲁·齐瑟曼

概述

CellDetect是[1]的MATLAB实现（参见项目页面).

CellDetect v1.0提供了用于学习基于点注释的细胞检测模型的代码，并编写代码，在给定的学习模型下检测新图像中的细胞。

该模型是从一组训练图像中学习的，其中每个细胞内只包含一个点。这是在一个结构SVM框架内通过最小化一个代价函数来实现的，该代价函数根据区域和点之间一对一对应的偏差来惩罚区域的选择。

包括一个相位对比图像的小数据集进行演示，并提供了一个预先训练的模型。

例子

相位对比显微镜中的细胞检测

下载

有关如何安装和使用代码的说明，请参阅README.txt。

• 细胞检测_v1.0（3.1 MB）：Matlab代码和演示数据集
• 自述.txt：说明和许可

相关出版物

致谢

这项工作得到了RCUK医疗创新博士培训中心（EP/G036861/1）和ERC第228180号VisRec拨款的支持。