乙醇酸氧化酶与结合活性位点抑制剂的三维结构。
公共医学 : 9144771 内政部: https://doi.org/10.1002/pro.55560060506 相关结构的主要引文: 1AL7公司 , 1AL8公司 PubMed摘要: 植物光呼吸的关键步骤是由过氧化物酶体黄素蛋白乙醇酸氧化酶(EC 1.1.3.15)将乙醇酸氧化为乙醛酸。 这种α/β桶蛋白的三维结构已被细化为2A分辨率(Lindqvist Y.1989)。 《分子生物学杂志》209:151-166)。 FMN依赖的乙醇酸氧化酶是α-羟基酸氧化酶家族的成员。 在此,我们描述了该酶的两种抑制剂复合物TKP(3-癸基-2,5-二氧代-4-羟基-3-吡咯烷)和TACA(4-羧基-5-(1-戊基)己基磺胺基-1,2,3-三唑)的结晶和结构测定。 TACA复合物的结构已被细化至2.6A分辨率,TKP复合物经分子替换后已被细化为2.2A分辨率。 TACA和TKP复合物的Rfree分别为24.2%和25.1%。 整体结构与未连接的全酶非常相似,但对活性位点的仔细检查显示,黄素异恶嗪环和TKP复合物中移位的柔性环的位置存在差异。 这两种抑制剂在结合模式和疏水相互作用方面存在差异,这些差异反映在抑制剂的Ki值非常不同,TACA为16 nM,TKP为4.8 microM。 讨论了这些酶-抑制剂复合物的结构对根据全酶结构提出的底物结合和催化模型的影响。