4V3U型

人类nNOS R354A G357D突变血红素结构域与N-2-(2-(1H-咪唑-1-基)嘧啶-4-基)乙基-3-(吡啶-3-基)丙胺配合物的结构


实验数据快照

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.30 Å
  • R值自由:0.235 
  • R值工作:0.189 
  • 观察到的R值:0.191 

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文学

新型2,4-二取代嘧啶类化合物作为神经元一氧化氮合酶的强效、选择性和细胞渗透性抑制剂。

穆克吉,P。李,H。塞夫里奥科娃,I。克雷菲,G。马塔塞克,P。罗曼,L.J。普洛斯,T.L。R.B.西尔弗曼。

(2015)医学化学杂志58:1067

  • 内政部:https://doi.org/10.1021/jm501719e
  • 相关结构的主要引文:
    4D2年,4D2Z型,4D30型,4D31型,4D32型,4D33型,4D34型,4D35型,4D36型,4D37型,4D38型,4天39,4D3A型,4D3B型,4个UCH,4V3U型,4伏3伏,4伏3瓦,4V3X型,4V3Y型,4V3Z型

  • PubMed摘要:

    选择性抑制神经元一氧化氮合酶(nNOS)是靶向神经退行性疾病的重要治疗手段。然而,开发的大多数nNOS抑制剂都是精氨酸模拟物,因此生物利用度较差。我们设计了一种新的策略,将一种更具药代动力学优势的2-咪唑基嘧啶头与以前抑制剂中有前景的结构成分结合起来。结合广泛的结构-活性研究,发现了几种高效和选择性的nNOS抑制剂。X射线晶体学分析表明,这些II型抑制剂利用相同的疏水囊来获得强大的抑制效力(13),以及较高的异构体选择性。有趣的是,从该系列(9)中选择的化合物在Caco-2分析中显示出良好的渗透性和低外排,表明潜在的口服生物利用度,并显示出与50个中枢神经系统受体的最小非靶向结合。此外,即使分子中含有血红素配位基团,修饰其他药效片段也能最大限度地减少人类肝微粒体细胞色素P450的不良抑制。


  • 组织附属关系

    美国伊利诺伊州埃文斯顿西北大学分子创新和药物发现中心生命过程化学研究所分子生物科学系化学系,邮编:60208-3113。


大分子
通过以下方法查找类似蛋白质:(通过身份截止)|3D结构
实体ID:1
分子链条序列长度有机体细节图像
一氧化氮合酶,脑420智人突变: 2 
UniProt&NIH共同基金数据资源
寻找蛋白质第29475页 (智人)
探索第29475页 
转到UniProtKB:第29475页
PHAROS公司:第29475页
GTEx公司:ENSG00000089250公司 
实体组 
序列簇30%身份50%身份70%身份90%身份95%身份100%身份
UniProt集团第29475页
序列注释
展开
  • 参考序列
小分子
配体5独特
身份证件链条姓名/配方/InChI密钥二维示意图3D交互

HEM查询

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E[认证A],
J[认证B],
N[认证C],
T[认证D]
含铁原卟啉IX
C类34H(H)32铁氮4O(运行)4
KABFMIBPWCXCRK-RGGAHWMASA-L公司
EG8(EG8)
EG8查询

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G[认证A],
L[认证B],
P[认证C],
V[认证D]
N-{2-[2-(1H-咪唑-1-基)嘧啶-4-基]乙基}-3-(吡啶-3-基)丙烷-1-胺
C类17H(H)20N个6
XOWPXRYZDHLBEA-UHFFFAOYSA-N公司
H4B型
H4B查询

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F[认证A],
K[认证B],
O[认证C],
U[认证D]
5,6,7,8-四氢生物蝶呤
C类9H(H)15N个5O(运行)
FNKQXYHWGSIFBK-RPDRRWSUSA-N公司
高尔夫球
GOL查询

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H[认证A],
M[认证B],
Q[认证C],
R[认证C],
W[授权D]
甘油
C类H(H)8O(运行)
PEDCQBHIVMGVHV-UHFFFAOYSA-N公司
ZN公司
ZN查询

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本人【授权A】,
S[认证C]
锌离子

PTFCDOFLOPIGGS-UHFFFAOYSA-N公司
绑定相关性注释
身份证件来源绑定相关性
EG8(EG8) 绑定数据库: 4V3U型 Ki公司:最小值:54,最大值:125(nM),来自2次分析
绑定MOAD: 4V3U型 Ki公司:125(nM),来自1次测定
实验数据和验证

实验数据

  • 方法:X射线衍射
  • 分辨率:2.30 Å
  • R值自由:0.235 
  • R值工作:0.189 
  • 观察到的R值:0.191 
  • 空间组:C 1 2 1
单位单元格:
长度(Ω)角度(˚)
a=175.559α = 90
b=84.63β = 91.96
c=167.269γ = 90
软件包:
软件名称目的
菲尼克斯精炼
MOSFLM公司数据缩减
无目标的数据缩放
相位器阶段划分

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