发布生物资源数据平台

公开了霉菌（Aspergillus属）的过敏原探索数据。（2024年3月27日）

进行了Aspergillus fumigatus NBRC113945的蛋白质组分析和已知变应原的探索。
※本项目是藤田医科大学医学部和NITE共同研究的一环。
项目详情请从这里看。
・[DBRP]蛋白质组分析_Aspergillus fumigatus NBRC113945

公开了生产抗真菌物质的放线菌的数据。（2024年3月27日）

由稀有放线菌制备培养提取物，测定其抗真菌活性等。
※本项目是作为科研制药株式会社和NITE共同研究的一环实施的。
登录DBRP的数据，请从这里看。
・生产抗真菌活性物质的稀有放线菌株的探索

更新了NBRC股票的数据。（2024年3月27日）

更新NBRC股票数据，新增531个股票信息、629个解析信息等。
更新的NBRC股票收藏的数据请从这里看。
・[DBRP]NBRC股

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DBRP概述

1. ・除了对NBRC拥有的生物资源积累的丰富数据之外，还从相关数据库中收集了物质生产和耐药等特性信息和文献信息，以及基因组等欧米克斯信息等各种信息，与生物资源相关联，一元化。这样，可以汇总检索关于生物资源的各种信息，可以有效地收集信息。
2. ・推进注册数据的日语化，可以用“乳酸菌”等一般的关键词进行检索。也可以从采集地（国名、地名）、分离源（食品由来等）进行检索，也可以选择数据的种类（基因组信息、图像信息等）进行检索。
3. ・具有各种机构的生物资源及其信息的登录功能。接受来自企业，大学，公共机关等的生物资源信息的登记。
4. ・关于详细情况什么是DBRP来修改标记元素的显示属性。

请从以下的横幅进入使用。

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DBRP Stanza概述

DBRP StanzaNBDC RDF Portal^＊的NBRC股票和理化学研究所的JCM股票的生物资源数据，是综合性地能检索的Web应用程序。

使用方法：DBRP Stanza来定义自定义外观。

＊NBDC RDF Portal：汇集了生命科学领域的RDF形式数据库的门户网站
 

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DBRP画面图像（点击图像即可放大）

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过去的通知

岐阜大学的GCMR（GTC股）的数据公开了。（2024年2月21日）

国立大学法人东海国立大学机构岐阜大学高等研究院微生物遗传资源保存中心（GCMR）公开了持有的GTC株的信息。
这是专门针对细菌的病原微生物的收藏，包括病原性、耐药性、有用产品等。DBRP公开了3320件股票信息及其相关信息（属性信息等）。
登录DBRP的GCMR（GTC股）收藏的数据请从这里看。
・[DBRP]GCMR（GTC株）

山形县工业技术中心有用株追加了微生物数据。（2024年1月31日）

在“山形县工业技术中心有用株”中追加了微生物的数据（微生物株信息1件）。
登录DBRP的1株微生物的数据，请从这里看。
・S 110 Lactococcus lactis

公开了财团法人发酵研究所取得的IFO株（现在是NBRC株）的生理、生化试验数据。（2024年1月31日）

关于2002年从公益财团法人发酵研究所（IFO）移交的NBRC株的一部分细菌，进行了发酵研究所拥有菌株时调查的表现性状的记录和光学显微镜图像的电子数据化，作为解析信息刊登。
登录DBRP的NBRC股票的表现性状数据，请从这里看。
・财团法人发酵研究所取得的IFO株（现在是NBRC株）的生理、生化试验数据

山形县工业技术中心有用股数据公开。（2023年11月8日）

此次，山形县工业技术中心公开了通过试验·研究取得的有用股票的数据。
这些有用的股票是在食品等的应用试验中选出成绩良好的股票。除了微生物株信息和相关的论文、图像信息之外，DBRP的特性信息中还刊登了“山形县_食品制造”的信息。
登录DBRP的山形县工业技术中心有用股的数据，请从这里看。
・山形县工业技术中心有用股

鸟取大学追加了TUFC菌株（蘑菇）的微生物数据。（2023年10月25日）

鸟取大学农学部附属菌类蘑菇遗传资源研究中心的“TUFC菌株（蘑菇）收藏”中追加了与184株微生物相关的文献信息数据。
登录DBRP的TUFC菌株（蘑菇）收藏的数据请从这里看。
・〔DBRP〕TUFC菌株（蘑菇）

国立研究开发法人海洋研究开发机构（JAMSTEC）的数据公开了。
（2023年10月5日）

此次，国立研究开发法人海洋研究开发机构（JAMSTEC）公开了从深海采集的微生物的信息。生活在深海极限环境中的微生物，与陆地上的微生物有着不同的固有生存战略，期待着作为各种创新的源泉的活用。此次公开的微生物菌株是从日本领海及专属经济水域（EEZ）内采集的，广泛提供给日本国内的民间企业、大学、研究机构。
在DBRP中注册的JAMSTEC股票收藏的数据这里查看项目中可用的所有族。

更新了RD股票的数据。（2023年8月23日）

添加了脂肪酶活性信息RD股追加了低温性酵母等数据，全部信息数为134440件（微生物株信息58576件、解析信息41532件等）。
在DBRP中注册的RD股票的数据这里查看项目中可用的所有族。

可以从DBRP下载RD股票的国内来源股票和海外来源股票的列表。（2023年8月23日）

现在可以从DBRP下载可提供RD股票的列表。
･来自国内的RD股票列表
･来自海外的RD股票列表

公开了Seed Bank股份有限公司的收藏。（2023年7月19日）

此次，公开了株式会社Seed Bank的收藏SeedBank库的信息。
SeedBank库中保存着各种各样的藻类，几乎覆盖了所有组的微藻类。DBRP包含SeedBank库的部分信息。
登录到DBRP的SeedBank库的数据请从这里看。
･SeedBank库

更新了RD股票的数据。（2023年7月19日）

RD股的数据，全部信息件数为134212件（微生物株信息58468件，解析信息41421件等）。
在DBRP中注册的RD股票的数据从这里开始请看。

公开了着眼于塞雷乌斯菌集团的数据库cereco。（2023年7月19日）

公开了支持Cereco菌群相关信息收集和质谱仪鉴定的系统“cereco”。
cereco由帮助通过质谱仪简便地进行分枝杆菌组鉴定的工具和能够收集DBRP中注册的现有分枝杆菌相关信息等的系统构成。
您需要一个帐户来查看DBRP的限制公共数据。关于账户制作，请参照下面的限制公开数据阅览的手续。

～cereco登录画面～
https://www.nite.go.jp/nbrc/cereco/login

～限制公开数据阅览的手续～
https://www.nite.go.jp/nbrc/genome/db/dbrp_howtoaccess.html

本项目由战略创新创造计划（SIP）“智能生物产业·农业基础技术”（管理法人：生研支援中心）实施。

添加了NITE持有株的5L培养数据。（2023年6月21日）

公开了NBRC株（3株）的培养数据（解析信息3件、实验信息3件）。
在DBRP中注册的培养数据如下。
・Lipomyces starkeyi NBRC10381的5L培养结果
・Scheffersomyces stipitis NBRC1687的5L培养结果
・Rhodococcus erythropolis NBRC100887的5L培养结果

公开了NBRC股票的解析数据。（2023年6月21日）

追加了NBRC株解析数据（基因组信息214件、细菌图像信息760件）。

更新了RD股票。（2023年5月24日）

RD股的数据，全部信息数为133426件（微生物株信息58440件、文献信息7749件、解析信息40679件等）。
在DBRP中注册的RD股票的数据从这里开始请看。

公开了与帕纳克株式会社共同事业得到的细胞外多糖类（EPS）的数据。（2023年4月26日）

通过与帕纳克株式会社（原公司名：帕纳克高级株式会社）的共同事业，公开了NITE拥有的具有多糖类产生能力的微藻类及其相关信息。
在DBRP上注册的“关于产生细胞外多糖（EPS）的藻株的筛选和EPS的商业利用的大量培养以及EPS的生理活性功能的研究的共同事业”的数据从这里开始请看。
关于细胞外多糖（EPS）数据的详细说明这里来修改标记元素的显示属性。

追加了静冈有用微生物库的微生物数据。（2023年4月26日）

静冈县的“静冈有用微生物库”收藏中，追加了从柿子果实中分离出的乳酸菌微生物1株的数据。
登录DBRP的1株微生物的数据，请从这里看。
・TIG-0429Lacticaseibacillus casei

对MALDI-TOF MS的数据进行了限制公开。（2023年3月29日）

DBRP限制公开了NBRC股（266股）和RD股（6股）的MALDI-TOF MS的数据。
公开的数据有微生物鉴定用文库（指纹判定法）数据和原始数据两种。
注册的项目包括：。
・项目（黄曲菌类缘菌_MALDI数据（for SARAMIS））
・项目（Lactobacillus_MALDI数据（for SARAMIS））
・项目（黄曲菌类缘菌_MALDI数据（for Biotyper）
・项目（Lactobacillus_MALDI数据（for Biotyper））
关于提供MALDI-TOF MS原始数据的详细说明这里来修改标记元素的显示属性。
关于提供MALDI-TOF MS微生物鉴定用文库（指纹判定法）这里来修改标记元素的显示属性。

更新了NBRC股票信息。（2022年11月24日）

更新了NBRC株的数据，全部信息数为100580件（微生物株信息58134件、文献信息7715件、解析信息8795件等）。

更新了数据的链接显示。（2022年9月29日）

更新了DBRP各信息页面下部的“链接到该数据的信息”的显示。

DBRP收录了10种信息，以微生物株信息为起点链接各种信息。
在这次的更新中，通过从列表显示变更为图形显示，可以掌握视觉上相关的信息量和链接状况。（参照DBRP画面图像DBRP微生物株信息画面）

增强了DBRP的搜索功能。（2022年6月23日）

在DBRP中添加了两个搜索功能。

①缩小检索
对于搜索结果，可以通过分离源、需氧性、属名等多个下拉菜单进行筛选。 

②同义词检索
DBRP搭载了同义词词典※。到目前为止，一直按照在搜索窗中输入的搜索词进行搜索，但也可以自动搜索与搜索词对应的同义词，显示结果。

例）检索“葡萄酒”的话，只有片假名的“葡萄酒”记载的数据作为检索结果被表示，不过，根据此次的改良“wine”的检索结果也一起被表示了。

※同义词词典是生命科学词典项目（http://www.life-science-dictionary.com）来定义自定义外观。

更新了DBRP的检索画面。（2022年5月25日）

根据用户们寄来的“检索窗的用途很难理解”的意见，更新了DBRP的检索画面。在更新后的检索画面上，记载了可以进行怎样的检索的说明，整理了检索菜单的配置。另外，为了成为容易使用的网站，整体上改变了菜单的配置，而且从青地上黄色大象给人留下深刻印象的画面，黄色大象也稍微改变了形状，以绿色为基调的画面焕然一新。今后也会积极采纳用户的意见，继续致力于提高用户的便利性。

追加了味之素株式会社质谱库的16S rDNA序列的同源性检索（BLAST）数据集。（2022年5月25日）

味之素株式会社的收藏「AJ株粘液细菌库」和「AJ株水生不完全菌库」，被菌种的简易识别等利用的16S核糖体蛋白质的碱排列新追加了。受此影响，这次追加的数组（数据集）和手头的数组可以进行同源检索（BLAST）。
您还可以查看每个已注册的数组信息。
 

鸟取大学TUFC菌株（蘑菇）收藏公开了（2022年3月2日）

此次，鸟取大学农学部附属菌类蘑菇遗传资源研究中心的「TUFC菌株（蘑菇）收藏（Tottori University Fungal Culture Collection）」的信息公开了。这是在DBRP中首次公开大学所有的菌株数据。

TUFC菌株（蘑菇）收藏以黄杨类、石竹类、木耳类等国产木材腐朽性野生蘑菇为中心，还含有菌根性的香菇类是由采集日和鉴定者等信息明确的菌株构成的日本最大级别的蘑菇菌株收藏。DBRP公开了1839件股票信息及其相关信息（文献信息等）。

登录DBRP的TUFC菌株（蘑菇）收藏的数据请从这里看。
・〔DBRP〕TUFC菌株（蘑菇）

更新了一部分使用条款。（2022年3月2日）

随着DBRP中谷歌Analytics的信息收集范围的变更《生物资源数据平台使用规约11.关于谷歌Analytics的使用“进行了如下变更。

○变更前
在DBRP中，为了掌握DBRP的利用状况，提高可用性，利用谷歌公司提供的谷歌Analytics。

○变更后（下划线部分为变更部位）
在DBRP中除了限制公开的页面以外为了掌握DBRP的利用状况，提高可用性，利用谷歌公司提供的谷歌Analytics。

公布了NITE持有株的免疫活性数据和NBRC株的更新数据。（2021年11月30日）

・关于NITE所持有的乳酸菌、肠内细菌的一部分，公开了免疫活性评价结果的数据。
登录DBRP的免疫活性数据，请从这里看。
   ・肠内细菌的免疫活性结果
   ・乳酸菌免疫活性结果
   ・肠内细菌的短链脂肪酸产量

・更新了NBRC株的数据，追加了686件株信息、588件古细菌、放线菌的图像等。

・NBRC股票字母表中所述修改相应参数的值。您可以在DBRP上看到注册的NBRC股票一览表。

追加了和歌山县5株酵母的数据。（2021年8月11日）

新追加了和歌山县的“和歌山县工业技术中心保有微生物资源”收藏，追加了生产像苹果一样具有香味的物质“己酸乙酯”的菌株等酵母5株的数据。

登录DBRP的“和歌山县工业技术中心保有微生物资源”的数据，请从这里看。
 ・〔DBRP〕和歌山县工业技术中心拥有的微生物资源

公开了NEDO智能小区项目中得到的分析数据。（2021年6月11日）（2021年6月8日）

此次，从2016年度到2020年度实施了的新能源·产业技术综合开发机构（NEDO）的利用植物等生物的高功能品生产技术的开发事业中描述的场景，使用以下步骤创建明细表，以便在概念设计中分析体量的体积。NEDO智能小区项目是一个旨在构建人工最大限度地发挥植物和微生物细胞所具有的物质生产能力的细胞，使有用物质生产产业化的项目，本次公开的16个课题的数据包括：基因组、基因表达量、蛋白质组、包括代谢综合征等共计1262件分析信息。
在NEDO智能小区项目中获得的这些有用的分析信息将在DBRP中公开，从而发现新的价值，随着利润的活用，智能小区技术有望加速有用物质的生产。16个课题的概要和其中2个课题的数据谁都可以阅览，剩下的14个课题的数据，在得到实施解析的机关的许可之后可以阅览（阅览所需的手续这里），模板名称将采用不同的格式。
在DBRP中注册的各课题的数据注册项目列表来修改标记元素的显示属性。

追加了同源性检索（BLAST）功能、账号登录功能等。（2021年6月8日）

1. ・追加了同源检索（BLAST）功能。可以对NBRC株的基因组碱基序列和氨基酸序列、国内来源筛选株（RD株）的核糖体RNA基因序列进行同源性检索。
2. ・追加了限制公开数据阅览用的账户登录功能。关于限制公开数据阅览这里来修改标记元素的显示属性。
3. ・追加了可以在画面上显示解析数据（表（tsv、csv）、图像）的下载文件内容的按钮。分析数据的页例这里来修改标记元素的显示属性。
4. ・关于NBRC株的株信息页面，追加了视觉易懂地表示微生物的危险度分类（生物安全水平（BSL）的信息的图标。NBRC股股票信息页例这里来修改标记元素的显示属性。

静冈县新增3株微生物数据（2021年5月18日）

静冈县的“静冈有用微生物库”收藏中，追加了从威士忌中分离出来的乳酸菌等3株微生物的数据。

登录DBRP的3株微生物的数据，请从这里看。
・NMZ-1139Lactobacillus plantarum
・NMZ-1200Lactobacillus harbinensis
・NMZ-1242Saccharomyces cerevisiae

在DBRP Stanza上可以显示与环境样品的元基因组分析结果同属的NBRC株一览（2021年4月9日）

在DBRP Stanza中icrobeDB.jp*中所述方法的备选方法。

DBRP Stanza从这里开始请使用。

*MicrobeDB.jp：以“基因”“系统”“环境”三个为轴心的微生物学数据综合制作的数据库

在NBRC株的株信息页面上追加了微生物分类和分离源等图标（2021年2月22日、3月16日）

关于NBRC股票的股票信息页面，追加了视觉上容易理解地显示以下4种信息的图标。
・微生物分类
・分离源
・生长温度
・同种保有株数（同一物种的NBRC和理化学研究所JCM中的保有株数）

NBRC股股票信息页例从这里开始请看。

公开了国内筛选股票（RD股票）的数据（2021年1月27日）

国内分离的NBRC持有的筛选株（RD株）开始公开约3万股的信息。来自国内的RD株，是从国内的强酸性温泉地等各种各样的环境，土壤·植物·发酵食品·海水等各种各样的分离源分离的菌株，作为新产品开发的筛选材料得到年间使用费（700日元/株·年）提供。含有很多在分类学上被推定为新的微生物（※）。
由此，不仅可以从网站上轻松地检索到至今为止仅通过Excel文件提供信息的RD株，还可以与NBRC株、企业、公设试验研究所所有的菌株一起进行“土壤”的分离源和“Saccharomyces”的属名等作为关键字检索成为可能，选择菌株的幅度特别扩大。
※通过核糖体RNA基因碱基序列分析进行评价。

在DBRP中注册的RD股票的数据从这里开始请看。

味之素株式会社的生物纤维素生产醋酸菌的质谱库（BPR质谱库）的数据公开了（2020年10月26日）

此次，味之素株式会社保有的，高产被期待新素材的开发的生物纤维素的醋酸菌株等约39株微生物和那个关联信息开始了公开。

在DBRP中注册的BPR库的数据从这里开始请看。

味之素株式会社、Technologa Lab株式会社的生物资源数据已公开（2020年9月14日）

此次，味之素株式会社保有的，被期待创造新医药领导化合物的水生不完全菌，粘液细菌等合计约600株微生物及其关联信息开始了公开。刊登了从自然界分离的菌株和育种株的信息，与各个菌株相关的文献·专利信息，系统解析用的基因排列信息等，汇集了味之素株式会社多年研究精华的资源和相关信息。

这次公开的株式会社技术骏河湾实验室的生物资源信息是关于丁酸产生菌的。在人和动物的肠内生存的丁酸产生菌大多是只有在没有氧的条件下才能生长的细菌（偏性厌氧菌），因此是很难采集和培养的细菌，但近年来，作为在人肠内维持健康状态的重要菌受到关注。株式会社Techno Sulga实验室所持有的丁酸产生菌株是从人源样品中分离出来的菌株，这次公开的信息中刊登了丁酸产生菌的概要和系统解析用的基因排列等。

登录DBRP的各公司的生物资源数据，请从这里看。
・[DBRP]味之素株式会社库
・[DBRP]株式会社技术骏河湾实验室库

详细情况请从这里看。

• ・【新闻发布】在生物资源数据平台上公开了约600株含有味之素株式会社持有的稀有微生物的信息
• ・【新闻发布】在生物资源数据平台上公开了期待新的健康食品开发株式会社技术骏河湾实验室的丁酸产生菌的信息

公开了静冈县和和歌山县的生物资源数据（2020年6月10日）

这次公开的静冈县的信息是从县内丰富的地域资源（从河津樱等采集的花和果实等）中分离出来的发酵食品中有用的酵母和乳酸菌等微生物菌株的文库（静冈有用微生物文库）。所有菌株在产品化前都进行了小规模试制试验，记载了产品化可能性高的菌株，DBRP的特性信息中刊登了“面包酵母”等信息。另外，各株信息中记载了“从河津樱分离”等信息。
和歌山县的信息是关于“Euglena gracilis Kishu（欧莱娜Kishu株）”的信息，刊登了生产一种叫做帕拉米隆的健康食品素材的物质、关于欧莱娜Kishu株的论文、专利的信息、图像信息。除了具有增殖快、耐高温的特征之外，由于氨基酸等营养素丰富，是可以作为食品原料使用的和歌山县的原创株。

登录DBRP的静冈县和和歌山县的生物资源数据，请从这里看。
・〔DBRP〕静冈有用微生物库
・〔DBRP〕E。gracilis Kishu的股票信息

了解更多信息【新闻发布】生物资源数据平台为激活新时代的区域经济做出贡献来修改标记元素的显示属性。

公开了DBRP Stanza（2020年4月22日）

作为DBRP的子系统，可以综合检索NBRC股票和理化学研究所的JCM股票的WEB应用（DBRP Stanza）公开了。

通过DBRP首页的“寻找微生物”可以指定分离源和原产地等条件进行检索（2020年4月22日）

1. ・在首页（检索画面）的“寻找微生物”中，为了方便符合目的的微生物检索，在检索条件中追加了“分离源”和“原产地”等7个新项目。
2. ・关于检索结果显示画面以及列表显示画面，追加了一览中显示的数据的排序功能。
3. ・在API中，也可以指定多个数据组的种类和检索词集，实施微生物的AND检索。