跳到主页内容
美国国旗

美国政府的官方网站

Dot政府

gov意味着它是官方的。
联邦政府网站通常以.gov或.mil结尾。之前分享敏感信息,确保你在联邦政府网站。

Https系统

该站点是安全的。
这个https(https)://确保您连接到官方网站,并且您提供的任何信息都是加密的并安全传输。

访问密钥 NCBI主页 MyNCBI主页 主要内容 主导航
.1997年8月5日;94(16):8411-6.
doi:10.1073/pnas.94.16.8411。

NADPH-细胞色素P450还原酶的三维结构:含FMN和FAD酶的原型

附属公司

NADPH-细胞色素P450还原酶的三维结构:含FMN和FAD酶的原型

M Wang先生等。 美国国家科学院程序. .

摘要

微粒体NADPH-细胞色素P450还原酶(CPR)是已知同时含有FAD和FMN的仅有的两种哺乳动物酶之一,另一种是一氧化氮合酶。CPR是一种膜结合蛋白,可催化NADPH到所有已知微粒体细胞色素P450的电子转移。大鼠肝脏CPR的结构在大肠杆菌中表达,并通过有限的胰蛋白酶溶解,已通过2.6 A分辨率的x射线晶体学测定。该分子由四个结构域组成:(从N端到C端)FMN结合域、连接域以及FAD和NADPH结合域。FMN结合域与黄曲霉毒素的结构相似,而两个C端二核苷酸结合域与铁氧还蛋白-NADP+还原酶(FNR)的结构相似。连接域位于FMN结合域和FNR样域之间,负责其他域的相对定向,确保有效电子转移所需的两种黄素的正确对齐。这两个黄素异恶嗪环并列,它们之间的最近距离约为4A。FMN结合位点附近的碗状表面可能是细胞色素c与生理氧化还原伙伴(包括细胞色素P450和b5以及血红素加氧酶)的对接位点。

PubMed免责声明

数字

图1
图1
CPR的FAD和FMN附近的电子密度立体图。第三个|F类o(o)| − 2|F类c(c)|用2.6计算电子密度图分辨率数据的等高线为1.2σ。与黄素环紧密接触的残留物被标记。四个芳香残基夹在黄素环之间:Y178和Y140用于FMN,Y456和W677用于FAD。
图2
图2
CPR的整体多肽折叠和拓扑图。(A类)显示CPR结构的功能区图。FMN结合域以蓝色显示,连接域以红色显示,FAD-和NADP(H)-域以绿色表示。辅因子显示为球和杆,带有FMN(浅蓝色)、FAD(黄色)和NADP+(橙色)。代表“铰链”的无序区域显示为粉红色(FMN结合域和连接域之间)。图形是使用生成的摩尔脚本(32)和光栅3d(33). (B)CPR蛋白的拓扑图,指示负责辅因子识别的区域。显示了α-螺旋线(开口圆柱)、β-股线(填充箭头)、随机线圈(线)和相应的残留数量。FMN域(I)、连接域(II)、FAD域(III)和NADP+域(IV)由方框标识。结构域II和III在线性序列中不连续,最后两个核苷酸结合结构域(III和IV)形成FNR样结构。α-螺旋以字母表示,β-链以从N到C的顺序编号。下图显示了CPR结构中域排列的线性图。每个辅因子结合结构域都被指出,连接结构域被描绘为点画框。方框上方的数字表示CPR结构中相应结构域的近似氨基酸位置。连接域和FAD-结合域以线性顺序交织在一起,但它们都是独特的结构域。
图3
图3
立体图显示FAD和FMN辅因子附近的残基。CPR中的FAD和FMN辅因子是定向的,以便两个异恶嗪环的二甲苯部分相互指向对方。FAD呈延伸构象。虚线表示潜在的氢键。为了清楚起见,图1中未绘制包含两个异柳氮环的芳香族残基。
图4
图4
CPR中辅因子排列的立体观察和结合NADP的多重构象+.电子从NADPH流向FAD,然后流向FMN。FMN和FAD用球棒表示,异恶嗪环的二甲苯部分相互朝向。NADP的腺嘌呤部分+以单一构象(球状和棒状)结合,而烟酰胺(仅棒状)以多种构象结合。通过围绕P旋转N个-O-P型A类键,烟酰胺环可以取代FAD环右侧的W677,使其处于从NADPH到FAD辅因子N5位置的氢化物转移的最佳方向。
图5
图5
CPR与其电子传递伙伴的假定对接面。(A类)显示CPR和细胞色素假定对接的带状图c(c)以代表CPR“坐”在膜表面的方向。CPR的N末端膜锚定部分,在结晶研究中被蛋白质水解去除,将向下突出到膜中。细胞色素c(c)(或细胞色素P450)在CPR分子的“前面”结合,使NADP(H)从上面自由进出,而FMN和FAD则埋在复合物中。CPR的域和辅因子被着色,如图2所示A类和细胞色素c(c)是粉红色的。因为细胞色素P450是膜结合的,所以这两种蛋白质的膜结构域之间的相互作用可能是“并排”的。(B)映射到CPR溶剂可及表面的静电势(左侧)和细胞色素c(c)(赖特). CPR视图与A类。正电势用蓝色表示,负电势用红色表示。电势用Delphi(43)计算,使用形式电荷,等高线为2.5千吨,并使用映射到溶剂可及曲面抓住(44). 从这个观点来看,很明显CPR和细胞色素之间的相互作用c(c)本质上主要是静电。细胞色素附着在CPR的假定表面c(c)绑定用虚线圆圈表示。
图6
图6
CPR家族关键成员辅因子结合区序列序列。该系列中的蛋白质包括:CPR、大鼠细胞色素P450还原酶;一氧化氮合酶;细胞色素P450 BM-3;销售代表,大肠杆菌亚硫酸盐还原酶;FDX、,D.普通黄曲霉毒素;和FNR,菠萝模糊神经网络。编号是给定蛋白质每个区域的第一个氨基酸。FDX和FNR的排列是通过将分子结构叠加到CPR结构上来实现的。

类似文章

引用人

  • NADPH氧化酶3:内耳以外。
    赫伯·M。 赫伯·M。 抗氧化剂(巴塞尔)。2024年2月8日;13(2):219. doi:10.3390/antiox13020219。 抗氧化剂(巴塞尔)。2024 PMID:38397817 免费PMC文章。 审查。
  • 两代海洋寄生蠕虫舌隐球虫的神经基因表达。
    托尔斯滕科夫·O、查茨盖奥·M、戈尔布欣·A。 Tolstenkov O等人。 公共生物。2023年12月18日;6(1):1279. doi:10.1038/s42003-023-05675-4。 公共生物。2023 PMID:38110640 免费PMC文章。
  • NADPH-细胞色素P450还原酶的克隆及功能研究乌头.
    程杰,李庚,王X,杨C,徐F,钱Z,马X。 Cheng J等。 分子。2023年11月3日;28(21):7409。doi:10.3390/分子28217409。 分子。2023 PMID:37959828 免费PMC文章。
  • 我们对SARS-CoV-2蛋白的功能了解多少?
    Justo Arevalo S、Castillo-Chávez A、Uribe Calampa CS、Zapata Sifuentes D、Huallpa CJ、Landa Bianchi G、Garavito-Salini Casas R、Quiñones Aguilar M、Pineda ChavarríA R。 Justo Arevalo S等人。 前免疫。2023年9月18日;14:1249607. doi:10.3389/fimmu.2023.1249607。eCollection 2023年。 前免疫。2023 PMID:37790934 免费PMC文章。 审查。
  • 细胞选择鉴定出支持电子转移到亚硫酸盐还原酶的细长黄曲霉毒素。
    Truong A、Myerscough D、Campbell I、Atkinson J、Silberg JJ。 Truong A等人。 蛋白质科学。2023年10月;32(10):e4746。doi:10.1002/pro.4746。 蛋白质科学。2023 PMID:37551563

工具书类

    1. 沈A L,卡斯珀C B.In:实验药理学手册。Schenkman J B,Greim H,编辑。纽约:Springer;1993年,第35-59页。
    1. Strobel H W,Hodgson A V,Shen S.In:细胞色素P450:结构、机制和生物化学。Ortiz de Montellano P R,编辑。纽约:全体会议;1995年,第225–244页。
    1. Williams C H,Kamin H.J生物化学。1962;237:587–595.-公共医学
    1. Phillips A H,Langdon R G.生物化学杂志。1962;237:2652–2660。-公共医学
    1. Schacter B A、Nelson E B、Marver H S、Masters B S S.生物化学杂志。1972;247:3601–3607.-公共医学

出版物类型

物质