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.2012年1月8日;44(2):148-56。
doi:10.1038/ng.1064。

染色质状态的组织特异性分析确定了胚胎发育过程中增强子活性的时间特征

附属公司

染色质状态的组织特异性分析确定了胚胎发育过程中增强子活性的时间特征

斯特凡·波恩等。 自然基因. .

摘要

染色质修饰与基因表达的许多方面有关,但它们在发育过程中的细胞转变中的作用仍不明确。在这里,我们使用一种新的方法来获得多细胞果蝇胚胎内染色质状态和RNA聚合酶II(Pol II)占有率的细胞类型特异性信息。我们直接评估了染色质修饰与增强子的时空活性之间的关系。活性发育增强子并没有独特的染色质状态,而是表现出异质性组蛋白修饰和Pol II占据。尽管存在这种复杂性,但结合染色质特征和Pol II的存在足以从头预测增强子活性。Pol II招募高度预测增强子活性的时间,似乎依赖于转录因子结合的时间和位置。染色质修饰通常划分出包含多个增强子的大调控区域,而核小体定位和Pol II占位的局部变化描绘出单个活性增强子。这种细胞类型特异性的观点确定了动态增强子的使用,这是破译发育网络的关键步骤。

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