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.2010年5月14日;4: 13。
doi:10.3389/fnsys。2010.00013。 eCollection 2010年。

DPARSF:静止状态fMRI“流水线”数据分析的MATLAB工具箱

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DPARSF:静止状态fMRI“流水线”数据分析的MATLAB工具箱

甘彦超等等。 前系统神经系统. .
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摘要

静息态功能磁共振成像(fMRI)以其有效、简便、无创性等优点,在探索人脑内在功能结构方面受到越来越多的关注。然而,对于静息状态功能磁共振成像的“管道”数据分析,用户友好的工具箱仍然缺乏。基于统计参数映射(SPM)和静息态fMRI数据分析工具包(REST)中的一些功能,我们开发了一个MATLAB工具箱,称为静止状态fMRI的数据处理助手(DPARSF),用于静息态fMRI的“流水线”数据分析。用户整理好DICOM文件后,点击几个按钮进行参数设置,DPARSF将给出所有预处理(切片定时、重新对齐、规范化、平滑)的数据和结果,用于功能连通性、区域均匀性、低频波动幅度(ALFF),分数ALFF。DPARSF还可以创建一个报告,排除头部运动过大的受试者,并生成一组图片,以便检查正常化的效果。此外,用户还可以使用DPARSF从感兴趣的区域提取时间课程。

关键词:DPARSF;休息;SPM;数据分析;静息状态功能磁共振成像。

数字

图1
图1
DPARSF图形用户界面.
图2
图2
检查规范化的图片. 标准化的功能图像被覆盖在一个高分辨率的三维解剖图像上(不透明的头骨图像)http://imaging.mrc-cbu.cam.ac.uk/downloads/Colin/在MNI空间中也以ch2)的形式与MRIcroN一起分布。用户可以很容易地通过视觉检查来检查空间标准化的准确性。
图3。
图3。
在ReHo(A)、ALFF(B)、fALFF(C)和PCC-FC(D)条件下的模式. 所有这些方法都揭示了默认模式网络的模式。图像下方的数字表示MNIz协调。统计阈值设置为t > 3.89美元(P < 0.0001)对于单尾t-测试(针对ReHo、ALFF和fALFF)和|t| > 4.08年(P < 0.0001),对于双尾t-测试(FC)和群集大小 >135毫米,对应于P < 0.0001。左半球;右半球。

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