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比较研究
.2000年9月;18(9):1001-5。
doi:10.1038/79269。

应用单核苷酸多态性阵列分析小细胞肺癌的异质性缺失

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比较研究

应用单核苷酸多态性阵列分析小细胞肺癌的异质性缺失

K林布拉德·托赫等。 Nat生物技术. 2000年9月.

摘要

人类癌症是由离散突变和染色体改变共同引起的。携带突变抑癌基因的染色体区域杂合性缺失(LOH)是上皮性和间叶性肿瘤进化的关键事件。通过使用多态性遗传标记对肿瘤进行等位基因分型,可以了解LOH的全球模式。简单序列长度多态性(SSLPs或微卫星)是研究LOH的可靠遗传标记,但由于基因分型程序相当繁琐,因此在LOH研究中仅使用了少量SSLPs。在这里,我们报告了一种高度并行的方法,用于对大量LOH单核苷酸多态性(SNP)进行基因分型,其中通过执行24个聚合酶链反应(PCR),汇集扩增产物,并将混合物杂交到高密度寡核苷酸阵列,对近1500个位点的样本进行基因型分析。我们对人类小细胞肺癌(SCLC)的LOH分析结果进行了表征,并通过杂交对DNA样本进行了控制。我们表明,LOH的模式与通过SSLPs和比较基因组杂交(CGH)分析获得的模式一致,而SNP阵列很少检测到扩增。结果验证了SNP阵列杂交在肿瘤研究中的应用。

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