转录组、表观遗传和蛋白质组/磷酸蛋白质组数据的整合(A) 基于差异表达聚类和PPI网络模块的蛋白质组和转录组数据集成方案。
(B) 综合分析中每个IPC中单个蛋白质归一化相对丰度的方框图。矩形表示第一到第三个四分位的四分位范围(IQR),方框内的水平线是中间值。矩形上方和下方延伸的垂直线表示最大值和最小值,不包括IQR 3倍以上的异常值。将数据归一化为成肌细胞,并显示每个IPC中的基因/蛋白质数量。每个IPC中的代表性基因/蛋白质以灰色显示。
(C) 测井热图10富集FDR用于每个IPC中基因/蛋白质的通路分析。对于IPC3,该集群中没有路径达到统计显著性(p值<0.05)。(D) IPC1的代表性PPI模块,显示E2F模块(蓝色圆圈)和G2/M个检查点模块(虚线圆圈)。
(E) G的扩展视图2/M检查点模块显示代表性基因/蛋白质。
另请参见表S6.