图2。

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与启动子/增强子活性相关的表观遗传谱差异

(A) 此分析中使用的18个chromHMM状态的热图。

(B) 热图描绘了ERMS和ARMS中基因组注释区域的18个chromHMM状态的比例。单个标记或区域的比例与蓝色的强度成正比。

(C) ChIP-seq峰值和chromHMMMYOG公司。右侧显示刻度,基因边界用虚线标记。

(D-F)代表性chromHMM气体安全标准2在ERMS(D)中选择性表达,NOS1号在ARMS(E)中选择性表达AXL公司在成肌细胞(F)中选择性表达。NOS1号包含基因上游的肿瘤类型特异性超增强子(装箱的H3K27Ac区域)。基因边界用虚线标记,每个状态的颜色如(A)所示。两个比例最高的状态是全高条,其余状态是半高条。每个条形图的强度与该基因在所有阶段的每个状态的百分比成正比。对于半高钢筋,强度从最大强度的50%开始缩放。

(G) ERMS中相对于ARMS的上调或下调(绿色)基因的文氏图。与在chromHMM状态(蓝色)或肿瘤类型特异性超增强子(红色)上有差异的基因重叠显示。

另请参见表S3.