45S前核糖体RNA基因的染色体定位(rna 45)它编码18S、5.8S和28S rRNA的前体RNA，使用pHr21Ab（5′部分为5.8-kb）和pHr14E3（3′部分为7.3-kb）片段作为FISH探针进行测定。探针所用的DNA片段由大阪国立生物医学创新、健康和营养研究所提供，并通过刻痕翻译用生物素16-dUTP（罗氏诊断）标记。杂交后，将载玻片与FITC-亲和素（Vector Laboratories）孵育。在XLA3L的短臂上检测到杂交信号（箭头），但在XLA3S上没有检测到。比例尺代表5μm。
包含嗅觉受体基因的大缺失(或)集群。的示意结构或第8染色体上的基因簇和邻近基因十、热带（XTR8）和X·莱维斯（XLA8L和XLA8S）。染色体位置：XTR8:107524547-108927581；XLA8L:105062063–106610199；XLA8S:91630596–92060451。水平条，基因组DNA序列；三角形，基因。外部或基因簇，仅显示代表性基因。三角形的长度是按比例计算的。三角形的方向指示基因的5′至3′方向。细线连接着同源/同源基因。品红色三角形，或基因；绿色三角形、假基因（点突变或截断或基因）。的数量或基因显示在基因簇下面。虚线，与XLA8L相比，XLA8S中的删除区域。着丝粒位于左侧，端粒位于右侧。
S（蓝色）和L（绿色）染色体上分别缺失的基因组区域的相对频率（左面板）和大小（右面板）。这两个亚基因组都经历了因缺失而导致的序列丢失，然而，S亚基因组上的缺失更大且更频繁。根据仙人掌序列在爪蟾L和S亚属和十、热带基因组。第9_10号染色体莱维斯根据与十、热带染色体。来自L的序列在S上不存在，但至少可以在十、热带，由不超过其长度25%的间隙组成，在S中被称为删除区域。对L中的删除区域也遵循相同的程序。
三联体基因座的识别如所述补充说明8.1根据基因2在两种基因中的存在情况，将基因座分为组X·莱维斯亚属（保留同源基因），与那些中间有假基因（假基因）或没有中间基因残余的亚属相比，通过脱殖（缺失）进行评估。为了使基因间长度正常化，我们将基因1和3之间的核苷酸距离分为拉埃维斯X.laevis亚属的直系距离十、热带。标准化比率分布的中位数绘制在条形图上。平均而言，S缺失似乎大于L缺失（52.9%的长度vs 80.2%的大小十、热带区域）。 将前体miRNA位点（红色）的RNA-seq读取对齐+/-1kb的数量与基因组中10000个随机未标记的2.1 kb区域（蓝色）的读取计数进行比较。所有83对同源、基因间miRNA对在其区域内均显示出对齐，而随机选择的基因间序列中只有4127/10000对（41.27%）。假定的primary-miRNA位点的读取计数也高于随机选择的表达区域（Wilcoxon p=1.4E-38）。
对CACTUS序列进行分析，以识别每个序列周围的侧翼CNE十、热带基因。单核细胞长度>50bp的CNE数量以红色显示，同源对数以蓝色显示。Komologov-Smirnov试验p值为1E-11。
计算每个染色体位点到最近基因的平均距离十、热带.单基因携带者的平均基因间距离X·莱维斯基因显示为红色，有两个基因的显示为蓝色。Wilcoxon p值=9.8E-24。
通过基因组足迹的基因保留分布十、热带正交曲线。我们将基因组足迹定义为CDS起始信号到终止信号（包括内含子）的基因组距离。x轴显示日志10（基因组足迹），y轴是每个仓的保留率。误差条是总数除以每个仓中基因数量的标准差。我们通过Wilcoxon检验测试了同源物和单重态之间长度的显著差异（p值=2.4E-96）。
根据CDS长度的基因保留分布十、热带正交曲线。x轴显示日志10（CDS长度），y轴是每个bin的保留率。误差条是总偏差除以每个bin中的基因数的标准差。我们通过Wilcoxon检验测试了同源基因和单倍体之间的长度差异（p值=1.7E-21）。
基因保留的外显子数分布十、热带正交曲线。x轴表示外显子的数量；y轴是每个bin的保留率。误差条是总偏差除以每个bin中的基因数的标准差。我们通过Wilcoxon检验测试了同源基因和单基因之间的长度差异（p值=3.2E-8）。
