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图2

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CPR的整体多肽折叠和拓扑图。(A类)显示CPR结构的功能区图。FMN结合域以蓝色显示,连接域以红色显示,FAD-和NADP(H)-域以绿色表示。辅因子显示为球和杆,带有FMN(浅蓝色)、FAD(黄色)和NADP+(橙色)。代表“铰链”的无序区域显示为粉红色(FMN结合域和连接域之间)。图形是使用生成的摩尔脚本(32)和光栅3d(33). (B类)CPR蛋白的拓扑图,指示负责辅因子识别的区域。显示了α-螺旋线(开口圆柱)、β-股线(填充箭头)、随机线圈(线)和相应的残留数量。FMN域(I)、连接域(II)、FAD域(III)和NADP+域(IV)由方框标识。结构域II和III在线性序列中不连续,最后两个核苷酸结合结构域(III和IV)形成FNR样结构。α-螺旋以字母表示,β-链以从N到C的顺序编号。下图显示了CPR结构中域排列的线性图。每个辅因子结合结构域都被指出,连接结构域被描绘为点画框。方框上方的数字表示CPR结构中相应结构域的近似氨基酸位置。连接域和FAD-结合域以线性顺序交织在一起,但它们都是独特的结构域。

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