信使核糖核酸具有比改组或密码子选择随机序列更大的负折叠自由能。

对GenBank中51个mRNA序列的检查表明，计算出的mRNA折叠比偶然预期的更稳定。与具有相同碱基组成和长度的随机mRNA序列相比，天然mRNA序列的自由能最小化计算结果更为负面。基因编码区的随机化产生的折叠自由能比原始天然信使核糖核酸序列的负能量小。密码子选择的随机性，在保留原始碱基组成的同时，也会导致mRNAs不太稳定。这表明密码子选择的偏差有助于形成有助于折叠稳定性的mRNA结构。