美国国立生物技术信息中心

从…开始。。。

SNP RS编号（例如rs58524323）

1. 在Entrez SNP中搜索rs编号。
2. 单击图形摘要中的蛋白质3D框。
3. 在结果表中，每个SNP都列出了三种氨基酸：参考蛋白中的残基（例如，NP_000231；蛋白质上下文）、SNP引起的残基变化以及序列最相似结构中的残基（结构相邻）。选中每个感兴趣SNP的“Cn3D”下的框。单击“选定”按钮。
4. 在下一页，SNP显示为灰色条上的彩色三角形，代表蛋白质序列。匹配结构如下所示。单击代表结构的粉色条。
5. 要在突出显示SNP位置的情况下查看Cn3D中的对齐，请单击“view structure and alignment in Cn3D”按钮。

单核苷酸多态性在PDB序列中的位置

1. 转到结构主页.
2. 在搜索框中输入PDB代码，然后按Go按钮。
3. 单击结构图像，然后在结果页面上单击“Cn3D中的结构视图”按钮。
4. 在Cn3D的序列/对齐窗口中，通过将鼠标指向序列中的残留物并读取窗口左下角的位置号来查找SNP位置。
5. 单击SNP位置的残基，该残基现在应该在序列和结构视图中变为黄色。有关更多信息，请参阅Cn3D教程.

SNP在带有接入号的蛋白质中的位置（例如NP_000231）

1. 转到蛋白质主页.
2. 在搜索框中输入蛋白质加入号，然后按Go按钮。
3. 单击右上角的Links下拉菜单并选择“Related Structures”。
4. 类似的结构将显示为查询序列下方的粉色条。使用坐标轴，选择包含SNP位置的结构。单击粉色栏。
5. 要在突出显示SNP位置的情况下查看Cn3D中的对齐，请单击“view structure and alignment in Cn3D”按钮。

单核苷酸多态性在蛋白质序列中的位置

1. 转到BLAST主页.
2. 单击Basic blast下的“protein blast”。
3. 将蛋白质序列粘贴到查询框中，并将数据库下拉菜单更改为“蛋白质数据库蛋白质（PDB）”。单击BLAST按钮。
4. 搜索完成后，单击报告顶部附近的“相关结构”链接。
5. 继续上述“SNP在具有登录号的蛋白质中的位置”下的步骤4。