如何:找到基因或基因产品的功能
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基因名称
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在NCBI主页上,单击搜索下拉菜单选择基因数据库,在文本框中键入基因名称,然后单击转到。 请参见 Gene帮助 有关搜索Gene的提示。 -
在结果中找到所需的基因记录,然后单击符号以打开该记录。 功能信息将位于摘要、参考书目和一般基因信息部分。 此外,请参阅链接列表以获取资源,如Conserved Domains和BioSystems。
蛋白质接入号(例如NP_005537)
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在NCBI主页上,通过在搜索框中键入登录号搜索所有数据库,然后单击Go按钮。 -
如果可能的话,在结果页面上选择基因数据库,并继续上面“基因名称”部分的步骤3。 如果在用于搜索的基因数据库中没有确定的记录,请选择蛋白质数据库。 如果您正在查看蛋白质记录,请单击页面右侧的“有关xxx基因的更多信息”链接(您可能需要向下滚动才能找到它)。 继续上述“基因名称”部分中的步骤3。 如果没有“关于xxx基因的更多信息”链接,在这个蛋白质记录页面的右上角,你可以点击“识别保守域”来“分析这个序列”。 结果页面将列出有关蛋白质功能域的信息。
核苷酸接入编号(例如NM_001126)
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在NCBI主页上,通过在搜索框中键入登录号搜索所有数据库,然后单击Go按钮。 -
如果可能,请在结果页面上选择基因数据库,然后继续上述“基因名称”部分中的步骤3。 如果在用于搜索的基因数据库中没有确定的记录,请选择核苷酸数据库。 如果您正在查看核苷酸记录,请单击页面右侧的“有关xxx基因的更多信息”链接(您可能需要向下滚动才能找到它)。 继续上述“基因名称”部分中的步骤3。 如果没有“关于xxx基因的更多信息”链接,请在此核苷酸记录页面的右下方,在“所有链接到此记录”部分中查找相关序列、蛋白质或PubMed的链接。 此外,您还可以通过单击“运行BLAST”来“分析此序列”,以查找BLASTn的相关核苷酸序列或BLASTx的相关蛋白质序列。 其中一些记录将直接链接到其“基因”页面,该页面可能会提供功能信息,如上述“基因名称”部分的步骤3中所述。
蛋白质序列
转到 BLAST主页 然后单击基本blast下的“蛋白质爆炸”。 将序列粘贴到查询框中,然后单击BLAST按钮。 点击结果中所需序列的登录号,继续上述“A蛋白质登录号”部分中的步骤4。
核苷酸序列
转到 BLAST主页 并单击Basic blast下的“nucleotide blast”。 将序列粘贴到查询框中,选择数据库,然后单击BLAST按钮。 从结果中单击所需序列的登录号,然后继续上述“A核苷酸登录号”部分中的步骤4。 此外,考虑使用序列运行BLASTx搜索以识别相关蛋白质。