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如何:找到基因或基因产品的功能

从…开始。。。

基因名称

  1. 在NCBI主页上,单击搜索下拉菜单选择基因数据库,在文本框中键入基因名称,然后单击转到。请参见Gene帮助有关搜索Gene的提示。

  2. 在结果中找到所需的基因记录,然后单击符号以打开该记录。

  3. 功能信息将位于摘要、参考书目和一般基因信息部分。此外,请参阅链接列表以获取资源,如Conserved Domains和BioSystems。

蛋白质接入号(例如NP_005537)

  1. 在NCBI主页上,通过在搜索框中键入登录号搜索所有数据库,然后单击Go按钮。

  2. 如果可能的话,在结果页面上选择基因数据库,并继续上面“基因名称”部分的步骤3。如果在用于搜索的基因数据库中没有确定的记录,请选择蛋白质数据库。

  3. 如果您正在查看蛋白质记录,请单击页面右侧的“有关xxx基因的更多信息”链接(您可能需要向下滚动才能找到它)。继续上述“基因名称”部分中的步骤3。
  4. 如果没有“关于xxx基因的更多信息”链接,在这个蛋白质记录页面的右上角,你可以点击“识别保守域”来“分析这个序列”。结果页面将列出有关蛋白质功能域的信息。

核苷酸接入编号(例如NM_001126)

  1. 在NCBI主页上,通过在搜索框中键入登录号搜索所有数据库,然后单击Go按钮。

  2. 如果可能,请在结果页面上选择基因数据库,然后继续上述“基因名称”部分中的步骤3。如果在用于搜索的基因数据库中没有确定的记录,请选择核苷酸数据库。

  3. 如果您正在查看核苷酸记录,请单击页面右侧的“有关xxx基因的更多信息”链接(您可能需要向下滚动才能找到它)。继续上述“基因名称”部分中的步骤3。
  4. 如果没有“关于xxx基因的更多信息”链接,请在此核苷酸记录页面的右下方,在“所有链接到此记录”部分中查找相关序列、蛋白质或PubMed的链接。此外,您还可以通过单击“运行BLAST”来“分析此序列”,以查找BLASTn的相关核苷酸序列或BLASTx的相关蛋白质序列。其中一些记录将直接链接到其“基因”页面,该页面可能会提供功能信息,如上述“基因名称”部分的步骤3中所述。

蛋白质序列

  1. 转到BLAST主页然后单击基本blast下的“蛋白质爆炸”。
  2. 将序列粘贴到查询框中,然后单击BLAST按钮。
  3. 点击结果中所需序列的登录号,继续上述“A蛋白质登录号”部分中的步骤4。

核苷酸序列

  1. 转到BLAST主页并单击Basic blast下的“nucleotide blast”。
  2. 将序列粘贴到查询框中,选择数据库,然后单击BLAST按钮。
  3. 从结果中单击所需序列的登录号,然后继续上述“A核苷酸登录号”部分中的步骤4。
  4. 此外,考虑使用序列运行BLASTx搜索以识别相关蛋白质。