审稿人和期刊编辑指南
访问私人数据
审查人员应期望收到审阅者令牌带着手稿。该令牌允许匿名，机密访问论文中引用的GEO私人记录。如果手稿中没有提供审阅者令牌，评审员应该联系期刊编辑，而不是GEO，请求生成评审员令牌。
一旦GEO提交完成并获得馆长批准，邀请作者生成审阅者令牌-这是一个非常快速的过程，作者只需登录他们的GEO帐户并单击'审阅者访问'位于其系列记录顶部的链接。指示作者将此令牌包含在当他们把手稿送到杂志上审阅时。期刊编辑应确保审稿人收到令牌。然后，审阅者可以在序列记录页面上输入令牌以获得访问权限。
这个关于微阵列实验（MIAME）的最低信息制定了指导方针MGED联盟概述描述微阵列实验所需的信息。许多期刊和资助机构要求微阵列数据符合MIAME。建议评审员使用这些指南来评估实验是否得到了充分描述。
GEO存款程序旨在鼓励符合MIAME的提交。在批准之前，每个提交文件都由GEO馆长进行评估。如果缺少关键的MIAME组件，馆长将尝试与作者合作，直到问题得到解决。然而，如果无法获得手稿的详细信息，我们可能很难评估是否确实提供了足够的描述性信息。此外，馆长只对数据中的明显错误（例如，重复或截断的表）进行基本检查；我们没有进行实际的数据分析，因此我们无法评估手稿中讨论的结论的有效性或准确性。
审查人员还应注意，并非所有GEO功能和下载都可用于私人记录。例如，批处理SOFT和MINiML系列转储、SeriesMatrix文件和补充文件的tar存档只有在记录公开后才能使用。
如果审核人员确定提交的文件不符合MIAME要求，或缺少对实验解释至关重要的信息，应要求作者相应更新其GEO记录。
MIAME有6个主要组件：
| A类 |
数组的文本描述 |
| B类 |
数组注释表 |
| C类 |
生物样本的文本描述及其所遵循的协议 |
| D类 |
处理后的杂交结果表
（可以选择包括原始数据列） |
| E类 |
原始数据注释和链接（如果提供） |
| F类 |
整体实验的文本描述 |
阵列模板在平台记录表中定义（区域“B类'在上示意图).
注释约定中存在很大的可变性。该表可以包含任意数量的列，但必须始终包含至少一类具有代表性的稳定列，阵列上每个特征的可跟踪序列标识符。这可能包括核苷酸序列本身、GenBank登录号、，公共克隆标识符或基因组坐标。基因名称本身并不理想，因为这些名称可能会随着时间而改变。ID列中的每个ID都是唯一的，并引用示例记录表的ID_REF列。
请注意，当使用商业数组时，作者将不会拥有Platform记录，也不会控制注释。
有时数组将表示一个“压缩”模板，例如，一个组合了复制探测的模板。在这些情况下，一个完整的模板也应提供，并将其作为“补充文件”链接附加到平台记录的底部。
提交人为其研究中的每个样本提供描述性信息和方案通过完成几个Sample属性字段（区域C类'在上示意图).下面描述了一个典型的记录，其中Sample注释以红色突出显示，协议以黄色突出显示。这些字段中的大多数是自由文本，可能包含大量信息来彻底描述样本特征和变量，以及它们的处理方式。
提示：要同时查看实验中所有样本的描述性数据，转到序列记录，并将页面顶部的工具栏设置为：
范围：样品
格式：HTML（或SOFT下载文本格式）
金额：简述
每个样本记录的底部都提供了关于处理数据的存在和位置的注释（面积'E类'在示意图).
如下面的示例所示，处理后的数据通常在Sample记录的表中提供（面积）D类'在上示意图).示例表可以包含任意数量的列，但所有表都包含价值表示提交者提供的最终处理值，以及ID_REF（标识_参考）引用相应平台记录中的ID列的列。
关于原始数据的存在和位置的注释在每个样本记录的底部（区域E类'在上示意图).
如下面的示例所示，原始数据通常以本机格式（例如，.CEL或.GPR）作为补充文件提供。
有时，原始数据列可能包含在Sample记录的表中（区域D类'在上示意图).
系列记录包括关于整个实验及其设计的信息（区域F类'在上示意图).大多数Series字段都是自由文本，可能包含大量信息，可用于彻底描述实验。
该系列还列出并链接了它包含的所有示例。
