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    TUB2A公司微管蛋白β2AⅡa类[智人(人类)]

    基因ID:7280,更新日期2024年4月7日

    总结

    官方符号
    TUB2A公司由提供HGNC公司
    官方全名
    微管蛋白β2AⅡa类由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:12412
    请参阅相关
    乐团:ENSG00000137267 MIM:615101; 联盟基因组:HGNC:12412
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已审核
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡塔里尼;人科;人类
    也称为
    TUBB;TUBB2;CDCBM5型
    总结
    微管是有丝分裂和细胞内转运等过程的关键参与者,由α-和β-微管蛋白的异二聚体组成。该基因编码的蛋白质是一种β-微管蛋白。该基因缺陷与复杂皮质发育不良和其他脑畸形相关-5。已发现该基因有两个编码不同亚型的转录变体。【由RefSeq提供,2015年7月】
    注释信息
    注:TUBB(GeneID:203068)和TUBB2A(Gene ID:7280)共用TUBB符号/别名。[2019年2月7日]
    表达式
    在大脑(RPKM 301.1)、骨髓(RPKM37.9)和16个其他组织中广泛表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    地点:
    第25.2页
    外显子计数:
    4
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 6 NC_000006.12(3153666..3157544,补遗)
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0版本(GCF_009914755.1号) 6 NC_060930.1(3020886..3024765,补码)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25) 6 NC_000006.11(3153900..3157778,补码)

    染色体6-NC_000006.12描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene receptor interacting serine/threonine kinase 1 Neighboring gene RNA, 5S ribosomal pseudogene 201 Neighboring gene uncharacterized LOC107986556 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:3118179-3118814 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16845 Neighboring gene biphenyl hydrolase like Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr6:3133721-3134377 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 23883 Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr6:3148774-3148935 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 16846 Neighboring gene uncharacterized LOC105374889 Neighboring gene CRISPRi-validated cis-regulatory element chr6.177 Neighboring gene CRISPRi-validated cis-regulatory element chr6.179 Neighboring gene hESC enhancers GRCh37_chr6:3165973-3166571 and GRCh37_chr6:3166572-3167171 Neighboring gene OCT4-NANOG-H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:3167172-3167770 Neighboring gene H3K27ac hESC enhancer GRCh37_chr6:3168370-3168967 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr6:3177505-3178025 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr6:3178965-3179464 Neighboring gene tubulin beta 2B class IIb pseudogene 1

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    包膜表面糖蛋白gp160前体 环境价值 用肌动蛋白解聚剂或微管蛋白聚合抑制剂处理细胞,可大大降低HIV-1 Gag和Env带帽细胞的百分比,这表明有效组装HIV-1需要完整的肌动蛋白和微管蛋白细胞骨架 公共医学
    Pr55(间隙) 堵住 用肌动蛋白解聚剂或微管蛋白聚合抑制剂处理细胞,可大大降低HIV-1 Gag和Env带帽细胞的百分比,这表明有效组装HIV-1需要完整的肌动蛋白和微管蛋白细胞骨架 公共医学
    利润 转速 HIV-1 Rev相互作用蛋白,TUBB2A,是由HeLa细胞胞浆或核提取物的体外结合实验确定的 公共医学
    转速 Rev作用于微管蛋白形成的微管解聚,这种作用在HIV-1感染期间观察到 公共医学
    塔特 塔特 与野生型相比,HIV-1 Tat K29A、K50R和K51R赖氨酸突变下调了细胞中可溶性微管蛋白的比例,而大多数其他赖氨酸变异上调了可溶性微管蛋白质的比例 公共医学
    塔特 在表达HIV-1 Tat的Jurkat细胞中,发现基本细胞骨架蛋白的表达水平降低,如肌动蛋白、β-微管蛋白、膜联蛋白、cofilin、凝胶蛋白和Rac/Rho-GDI复合物 公共医学
    塔特 HIV-1 Tat(特别是氨基酸38-72)增强微管蛋白聚合并触发线粒体途径诱导T细胞凋亡,如离体线粒体释放细胞色素c所示 公共医学
    塔特 HIV-1 Tat(氨基酸36-39)结合微管蛋白α/β二聚体和聚合微管,导致微管动力学的改变和线粒体依赖性凋亡途径的激活,而Bcl-2相关的Bim促进了该途径的激活 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    • MARC_24019-24020:102775248:1(电子聚合酶链式反应)

    克隆名称

    • dJ40E16.7型

    一般蛋白质信息

    首选名称
    微管蛋白β-2A链
    姓名
    Ⅱa类β-微管蛋白
    微管蛋白,β2A
    微管蛋白,β多肽2

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_042223.1参考序列基因

      范围
      5006..8884
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001069.3号NP_001060.1型微管蛋白β-2A链亚型1

      参见NP_001060.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:该变体(1)编码较长的亚型(1)。
      源序列
      AL031963、AL038778、X79535
      共识CDS
      CCDS4484.1公司
      UniProtKB/瑞士Prot
      问题13885,青6FGZ8,问题8IWR2
      UniProtKB/TrEMBL公司
      B2R6L0型
      相关的
      ENSP0000369703.2号文件,ENST00000333628.4标准
      保守领域(1)总结
      PLN00220
      地点:1430
      PLN00220;微管蛋白β链;临时的
    2. NM_001310315.2NP_001297244.1型微管蛋白β-2A链亚型2

      参见NP_001297244.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)在最后一个外显子的5'端使用交替剪接连接,并在交替起始密码子处开始翻译。与同种型1相比,得到的同种型(2)具有更短且不同的N末端。
      源序列
      BC018780、BM846690、BP381259
      UniProtKB/TrEMBL公司
      O43209号机组
      保守领域(1)总结
      PLN00220
      地点:2345
      PLN00220;微管蛋白β链;临时的

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000006.12参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      3153666..3157544补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060930.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      3020886..3024765补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)