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    TSG101型肿瘤易感性101[智人(人类)]

    基因ID:7251,更新日期2024年4月23日

    总结

    官方符号
    TSG101型由提供HGNC公司
    官方全名
    肿瘤敏感性101由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:15971
    请参阅相关
    乐团:ENSG0000074319 MIM:601387; 联盟基因组:HGNC:15971
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;灵长类;Haplorhini;卡他病;人科;人类
    也称为
    TSG10;VPS23系列
    总结
    该基因编码的蛋白质属于泛素结合酶的一组明显不活跃的同源物。该基因产物包含一个与stathmin(一种与肿瘤发生有关的胞浆磷蛋白)相互作用的螺旋结构域。该蛋白可能在细胞生长和分化中发挥作用,并充当负性生长调节剂。这种肿瘤易感基因的体外稳态表达对于维持基因组稳定性和细胞周期调控似乎很重要。该基因的突变和选择性剪接在乳腺癌中高频率发生,并表明缺陷发生在乳腺癌的肿瘤发生和/或进展过程中。[由RefSeq提供,2008年7月]
    表达式
    睾丸(RPKM34.7)、肾上腺(RPKM31.6)和25个其他组织中普遍表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    位置:
    11页15.1
    外显子计数:
    11
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 11 NC_000011.10(18480311..18526942,补码)
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 11 NC_060935.1(18578331..18624993,补体)
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 11 NC_000011.9(18501858..18548489,补体)

    11号染色体-NC_000011.10描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene lactate dehydrogenase C Neighboring gene lactate dehydrogenase A like 6A Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr11:18507685-18507894 Neighboring gene tyrosine 3-monooxygenase/tryptophan 5-monooxygenase activation protein beta pseudogene 2 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 4502 Neighboring gene UEV and lactate/malate dehyrogenase domains Neighboring gene ReSE screen-validated silencer GRCh37_chr11:18600575-18600756 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 4503 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 4504 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 4505 Neighboring gene Sharpr-MPRA regulatory region 13786 Neighboring gene uncharacterized LOC112268073 Neighboring gene MTCH1 pseudogene 2

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:HPA RNA-seq正常组织
    • 描述:对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq,以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目:项目编号:4337
    • 出版物:项目管理标识号24309898
    • 分析日期:2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    HIV-1相互作用

    复制交互

    互动 酒吧
    HIV-1将PDCD6IP(ALIX)和TSG101合并到病毒中,病毒对YP和PTAP域的突变分别敏感 公共医学
    TSG101的siRNA敲除破坏了p24/p2到p24的末端裂解,并破坏了HIV的释放(来自siRNA的顺序转染和质粒HIVdeltaEnv(pBH10));TSG101增强了HIV的释放 公共医学
    在U1/HIV-1细胞(慢性感染的单核细胞样细胞每细胞携带2个完整的HIV前病毒拷贝)中TSG101的siRNA敲除降低上清液中CA(p24)的水平,但不降低细胞内CA(p25)的水平 公共医学
    siRNA敲低肿瘤易感基因101(TSG101)抑制HeLa P4/R5细胞HIV-1复制 公共医学

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    奈夫 nef(奈夫) HIV-1 Nef诱导转染Nef-GFP编码DNA构建物的Jurkat T细胞释放TSG101(MAL-dependent exosome marker) 公共医学
    nef(奈夫) 在Nef转染的293T细胞中,在去污剂不溶性AChE+/CD81低/TSG101低外泌体中检测到HIV-1 Nef,但在去污液溶性ACh-/CD81高/TSG101高外泌体内未检测到 公共医学
    nef(奈夫) HIV-1 Nef与HIV-1感染患者细胞外囊泡中TSG101相关 公共医学
    Pr55(间隙) 堵住 HIV-1 Gag将PDCD6IP(ALIX)和TSG101合并到病毒中 公共医学
    堵住 TSG101的敲除削弱p24/p2到p24的末端裂解 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag和ESCRT蛋白(TSG101、ALIX、CHMP4B和CHMP4C)的超分辨成像表明,在HeLa细胞中,Gag集合通常在其附近有ESCRT蛋白 公共医学
    堵住 三维超分辨显微镜和相关电子显微镜显示,ESCRT蛋白TSG101、CHMP2A和CHMP4B与膜定位HIV-1 Gag在组装位点共簇合 公共医学
    堵住 Tsg 101、VPS 28和VPS 37B形成了运输所需的人类内胚体分选复合体(ESCRT-I),这是HIV-1 Gag出芽和病毒感染所需的复合体 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag中缺失HIV-1 NC锌指2基序会损害TSG101在质膜上的募集及其与病毒的结合 公共医学
    堵住 释放的Gag VLP包含TSG101和CHMP4B,但CHMP2A相对于CHMP4B的水平降低 公共医学
    堵住 融合蛋白Dub-TSG101是融合到TSG101上的单纯疱疹UL36氘化酶(Dub)的催化结构域,它抑制HIV-1的释放,这涉及HIV-1 Gag和TSG101之间的相互作用 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag和TSG101之间的相互作用增强了HeLa细胞中的系链蛋白募集。Gag p6结构域内的TSG101和ALIX结合位点都增强了T细胞中Gag组装位点的栓系蛋白募集 公共医学
    堵住 AIP1与HIV-1 p6(氨基酸41-44)中的LXXLF基序结合,也与TSG101结合,作为病毒芽变机制的组成部分 公共医学
    堵住 TSG101的UEV域(氨基酸1-145)与HIV-1 p6-Gag的L域(氨基酸7-10)的直接结合对于HIV-1病毒从感染细胞中p6定向出芽至关重要 公共医学
    堵住 TSG101与HIV-1 Gag结合与IP3R重新分布到质膜相关 公共医学
    堵住 Tal是一种Tsg101相关连接酶,结合并泛素化Tsg01;Tal-介导的Tsg101结合和泛素化协同调节HIV-1 Gag的释放 公共医学
    阻塞 HIV-1 Gag中的p1间隔肽可提供Tsg101结合的要求。从正宗HIV-1中去除NC-p1区域可减轻对显性阴性CHMP3的敏感性 公共医学
    堵住 GAT结构域中的PTAP序列(179-182)和Tom1L1 C末端区域中的PSAP序列(310-313)是与Tsg101的UEV结构域(1-145)相互作用并与HIV-1 Gag竞争所必需的 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag的表达减弱SDF-1介导的CXCR4的下调。Gag的作用取决于Gag的C末端p6区域内的TSG101相互作用基序 公共医学
    堵住 Alix的Bro1结构域通过靶向PTAP/TSG101和LYPXnL/Alix通路抑制HIV萌芽。Gag的NC域是通过Gag介导的Bro1向质膜募集来抑制Bro1的主要靶点 公共医学
    阻塞 一种基因选择的环肽IYWNVSGW通过靶向Gag和TSG101的p6结构域之间的相互作用抑制HIV出芽。肽的抑制活性依赖于PT/SAP 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag的P(S/T)AP基序中Thr或Ser残基的羟基与Asn69的主链形成氢键。Asn突变为Pro可消除与TSG101结合的PTAP基序并阻断HIV-1在细胞中的出芽 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag的p6结构域模拟了人类Hrs蛋白的Tsg101再纯化活性 公共医学
    Vpr(Vpr) 虚拟专用数据库 HIV-1 Vpr与TSG101竞争以绑定Gag 公共医学
    虚拟专用数据库 HIV-1 Vpr消除TSG101过度表达对支持病毒样颗粒释放的影响 公共医学
    Vpu公司 虚拟专用单元 Vpu的生理水平需要核心ESCRT途径(TSG1010和UBAP1)和HGA(HRS)来降解Vpu介导的BST-2(栓蛋白),但不需要这些蛋白质来抵消BST2(栓蛋白的)物理抗病毒活性 公共医学
    衣壳 阻塞 在U1/HIV-1细胞中TSG101的siRNA敲除(慢性感染的单核细胞,每个细胞含有2个完整的HIV前病毒拷贝)影响(降低)上清液中CA(p24)的水平,但不影响细胞内CA(p25)的水平 公共医学
    堵住 TSG101的敲除削弱p24/p2到p24的末端裂解 公共医学
    核衣壳 堵住 HIV-1 Gag中HIV-1 NC锌指2基序的缺失损害了TSG101在质膜(PM)的募集及其与病毒的结合,表明NC-介导的TSG101向Gag组装位点的募集发生在PM 公共医学
    第2页 堵住 基于9种HIV-1蛋白与已知相互作用的人类蛋白的结构相似性的计算方法预测,HIV-1 gp41、IN和Gag的p2区域可能都能与TSG101相互作用 公共医学
    堵住 TSG101的敲除削弱p24/p2到p24的末端裂解 公共医学
    第6页 堵住 TSG101的UEV域(氨基酸1-145)与HIV-1 p6-Gag的L域(氨基酸7-10)的直接结合对于HIV-1病毒从感染细胞中p6定向出芽至关重要 公共医学
    堵住 AIP1与HIV-1 p6(氨基酸41-44)中的LXXLF基序结合,也与TSG101结合,作为病毒芽变机制的组成部分 公共医学
    堵住 ESCRT-I复合物包含三个常见亚单位(TSG101、VPS28和VPS37)和第四个亚单位MVB12。重组ESCRT-I复合物结合HIV-1 p6 公共医学
    堵住 将N-烷基甘氨酸(“肽类”)残基用于p6衍生的9肽序列“PEPTAPEE”可提高肽与TSG101泛素E2变异结构域的结合亲和力 公共医学
    堵住 NEDD4L介导的病毒出芽刺激依赖于NEDD4L的泛素连接酶活性,只需要最小的HIV-1 Gag组装区和TSG101 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag的表达减弱SDF-1介导的CXCR4的下调。Gag的这种效应依赖于Gag的C末端p6区域内的TSG101相互作用基序 公共医学
    堵住 一种基因选择的环肽IYWNVSGW通过靶向Gag和TSG101的p6结构域之间的相互作用抑制HIV出芽。肽的抑制活性依赖于PT/SAP 公共医学
    堵住 HIV-1 p6的P(S/T)AP基序中的Thr或Ser残基的羟基与Asn69主链形成氢键。Asn突变为Pro可消除与TSG101结合的PTAP基序并阻断HIV-1在细胞中的出芽 公共医学
    堵住 HIV-1 Gag的p6结构域模拟了人类Hrs蛋白的Tsg101再纯化活性 公共医学
    堵住 HIV-1 p6中的短螺旋(螺旋-1;氨基酸残基14-18)增强了p6-PTAP基序(残基7-10)与TSG101的结合 公共医学
    逆转录酶 插科打诨 通过siRNA介导的TSG101表达下调,HIV-1晚期RT活性特异性增加,表明TSG101抑制HIV-1在病毒释放前将其基因组反向转录到DNA中 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 GOA提供

    过程 证据代码 酒吧
    参与自噬体成熟 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞周期 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞分裂 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    涉及内体到溶酶体的转运 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与外体分泌物 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞外运输 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与角质形成细胞分化 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与宏观自噬 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    卷入膜裂变 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    介入性多泡体组件 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    介入性多泡体组件 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞群体增殖的负调控 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与表皮生长因子受体信号通路的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与表皮生长因子激活受体活性的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与RNA聚合酶II对转录的负调控 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与外体分泌的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与泛素依赖性内吞作用的正调控 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    通过宿主ESCRT复合物参与病毒出芽的正调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质改性过程 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    通过多泡体分选途径参与泛素依赖性蛋白分解代谢过程的参与蛋白向液泡的转运 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与MAP激酶活性的调节 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞周期调控 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与细胞生长调控 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    参与胞外外体组装的调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    通过多泡体分选途径参与泛素依赖性蛋白分解代谢过程 集成电路
    馆长推断
    更多信息
    公共医学 
    通过多泡体分选途径参与泛素依赖性蛋白分解代谢过程 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    通过多泡体分选途径参与泛素依赖性蛋白分解代谢过程 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与病毒出芽 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与病毒出芽 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    通过宿主ESCRT复合物参与病毒出芽 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    参与病毒从宿主细胞释放 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    组件 证据代码 酒吧
    ESCRT I复合体的一部分 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    ESCRT I复合体的一部分 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    ESCRT I复合体的一部分 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    ESCRT I复合体的一部分 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    ESCRT I复合体的一部分 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    located_in Flemming车身 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于中心体 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    位于细胞质中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    位于细胞质中 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    定位于胞浆中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
     
    位于早期内体 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于早期内体膜 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于内体 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位内体膜 北美
    不可追踪的作者声明
    更多信息
    公共医学 
    定位于内体膜 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    定位于胞外外体 HDA公司 公共医学 
    定位于胞外外体 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于晚期内体 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    定位于晚期内体膜 国际原子能机构
    从电子注释推断
    更多信息
     
    定位于多泡体 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    公共医学 
    核仁定位 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
     
    定位于质膜 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    肿瘤易感基因101蛋白
    姓名
    ESCRT-I复合亚基TSG101
    肿瘤易感基因10
    肿瘤易感基因101
    肿瘤敏感蛋白

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    基因组学

    1. NG_012138.2参考序列基因

      范围
      5001..51632
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. NM_006292.4号NP_006283.1号肿瘤易感基因101蛋白

      参见NP_006283.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已审阅

      源序列
      BP347883、CB528488、U82130
      共识CDS
      CCDS7842.1号机组
      UniProtKB/瑞士Prot
      问题99816问题9BUM5
      UniProtKB/TrEMBL公司
      F5H442楼
      相关的
      ENSP00000251968.3标准ENST00000251968.4标准
      保守领域(3)总结
      pfam05743型
      位置:21139
      UEV;UEV域
      pfam07798型
      位置:236292
      DUF1640;功能未知的蛋白质(DUF1640)
      辉瑞09454
      位置:316375
      Vps23_核;Vps23核心域

    注释基因组的参考序列:GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000011.10参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      18480311..18526942补码
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_005253108.5号XP_005253165.1号肿瘤易感基因101蛋白亚型X1

      参见XP_005253165.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/TrEMBL公司
      F5H442楼
      保守领域(3)总结
      pfam05743型
      位置:187
      UEV;UEV域
      pfam07798型
      位置:184240
      DUF1640;功能未知的蛋白质(DUF1640)
      pfam09454型
      位置:264323
      Vps23_核;Vps23核心域

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060935.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      18578331..18624993补码
      下载
      GenBank(基因银行)美国金融服务贸易协会序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_054369804.1号XP_054225779.1号肿瘤易感基因101蛋白亚型X1