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    TSPO公司易位蛋白[智人（人类）]

    基因ID:706，更新日期2024年4月11日

    总结

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    官方符号
    TSPO公司由提供HGNC公司
    官方全名
    易位蛋白由提供HGNC公司
    主要来源
    HGNC:HGNC:1158
    请参阅相关
    乐团：ENSG00000100300 MIM:109610； 联盟基因组：HGNC:1158
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorrhini公司；卡塔里尼；人科；人类
    也称为
    DBI；IBP；MBR；PBR；PBS；BPBS；BZRP；PKBS；PTBR；mDRC；pk18；TSPO1号机组
    总结
    该基因编码的蛋白质主要存在于外周组织的线粒体区室中，与一些苯二氮卓类药物相互作用，并与其内源性对应物具有不同的亲和力。蛋白质是胆固醇流入线粒体的关键因素，可以启动类固醇激素的合成。另外，还报道了剪接转录变体；其中一个变体缺乏内部外显子，被认为是非编码的，而其他变体编码相同的蛋白质。[由RefSeq提供，2012年2月]
    表达式
    骨髓（RPKM 105.6）、脂肪（RPKM61.4）和20个其他组织中广泛表达查看更多信息
    直系同源
    鼠标 全部的
    新款
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    基因组背景

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    参见中的TSPO基因组数据查看器
    位置：
    22季度13.2
    外显子计数：
    5
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2023_10号 现在的 GRCh38.p14型(GCF_000001405.40) 22 NC_000022.11（43151559..43163242）
    RS_2023_10号 现在的 T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号) 22 NC_060946.1（43632715..43644077）
    105.20220307 上一个程序集 GRCh37.p13型(GCF_000001405.25号) 22 NC_000022.10（43547565..43559248）

    染色体22-NC_000022.11描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43506823-43507381 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13854 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 19183 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43524576-43525453 Neighboring gene Neanderthal introgressed variant-containing enhancer experimental_63425 Neighboring gene BCL2 interacting killer Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13855 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 19185 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13856 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 19186 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43553089-43553609 Neighboring gene malonyl-CoA-acyl carrier protein transacylase Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43559052-43559555 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43559556-43560058 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43564214-43565070 Neighboring gene H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43565071-43565926 Neighboring gene tubulin tyrosine ligase like 12 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43581791-43582295 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid active region 19188 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13857 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13858 Neighboring gene ATAC-STARR-seq lymphoblastoid silent region 13859 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43593145-43594077 Neighboring gene H3K27ac-H3K4me1 hESC enhancer GRCh37_chr22:43594078-43595009 Neighboring gene signal peptide, CUB domain and EGF like domain containing 1 Neighboring gene SCUBE1 antisense RNA 2

    基因组区域、转录物和产物

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    表达式

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    • 项目名称：HPA RNA-seq正常组织
    • 描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
    • 生物项目：项目编号：4337
    • 出版物：项目管理标识号24309898
    • 分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

    参考文献

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    PubMed中的相关文章

    1. TSPO作为一种免疫抵抗基因参与T细胞介导的胶质母细胞瘤免疫控制。 Menevse AN公司，等《神经病理学学报》，2023年5月8日。PMID 37158962，免费PMC文章
    2. 转运蛋白18kDa（TSPO）缺乏对人C20小胶质细胞线粒体功能和炎症状态的影响。 巴德·S，等细胞，2023年3月21日。PMID 36980295，免费PMC文章
    3. 转运蛋白18 kDa（TSPO）作为治疗慢性疼痛的新靶点。 刘杰，等《神经整形》，2022年。PMID 36071748中，免费PMC文章
    4. 人类易位蛋白及其A147T多态性变体之间线粒体蛋白相互作用的差异。 阿西公关，等《公共科学图书馆·综合》，2022年。PMID 35522669，免费PMC文章
    5. 转运蛋白18-kDa：治疗神经炎症相关退行性疾病的潜在靶点。 Tremolanti C，等Curr Med Chem，2022年8月6日。PMID 35430971号

    查看PubMed中的所有（201）引文

    GeneRIFs：功能的基因引用

    什么是GeneRIF？
    1. 整合TSPO PET成像和转录组学，揭示神经炎症和淀粉样β沉积在阿尔茨海默病中的作用。
      标题：整合TSPO PET成像和转录组学，揭示神经炎症和淀粉样β沉积在阿尔茨海默病中的作用。
    2. 脑膜瘤肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中转运蛋白（TSPO）的表达。
      标题：脑膜瘤中肿瘤细胞和肿瘤相关巨噬细胞中的转运蛋白（TSPO）表达。
    3. 调查职业相关创伤后应激障碍患者的TSPO水平。
      标题：调查职业相关创伤后应激障碍患者的TSPO水平。
    4. [[18]F]DPA-714：联合用药、年龄、性别、BMI和TSPO多态性对人类血浆输入功能的影响。
      标题：[（18）F]DPA-714：联合用药、年龄、性别、BMI和TSPO多态性对人类血浆输入功能的影响。
    5. TSPO调节寡聚淀粉样β诱导的单核细胞趋化性：与阿尔茨海默病神经炎症的相关性。
      标题：TSPO调节寡聚淀粉样β诱导的单核细胞趋化性：与阿尔茨海默病中的神经炎症相关。
    6. 阿尔茨海默病线粒体蛋白TSPO：与AD病理严重程度和神经炎症环境的关系。
      标题：阿尔茨海默病中的线粒体蛋白TSPO：与AD病理严重程度和神经炎症环境的关系。
    7. TSPO作为一种免疫抵抗基因参与T细胞介导的胶质母细胞瘤免疫控制。
      标题：TSPO作为一种免疫抵抗基因参与T细胞介导的胶质母细胞瘤免疫控制。
    8. Sigma-2受体配体结合调节TSPO和TMEM97之间的关联。
      标题：Sigma-2受体配体结合调节TSPO和TMEM97之间的关联。
    9. 转运蛋白18kDa（TSPO）缺乏对人C20小胶质细胞线粒体功能和炎症状态的影响。
      标题：转运蛋白18kDa（TSPO）缺乏对人类C20小胶质细胞线粒体功能和炎症状态的影响。
    10. 神经炎症和精神疾病：C1q、易位蛋白（18kDa）（TSPO）和神经甾体的相关性。
      标题：神经炎症和精神疾病：C1q、易位蛋白（18 kDa）（TSPO）和神经甾体。
    提交： 新GenerRIF 更正 查看所有GenerRIF（168）

    表型

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    在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

    使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

    变更

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    参见ClinVar中的变量

    参见dbVar中的研究和变体

    参见变体查看器（GRCh37.p13）

    参见变体查看器（GRCh38）

    基因型

    HIV-1相互作用

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    复制交互

    互动 酒吧
    shRNA敲除TSPO增强HIV-1在非许可NKR细胞中的复制 公共医学

    蛋白质相互作用

    蛋白质 基因 互动 酒吧
    包膜表面糖蛋白gp120 环境价值 用TSPO拮抗剂治疗或shRNA敲除TSPO通过恢复HIV-1 gp120/gp41的生物发生激活非许可NKR细胞中HIV-1的复制 公共医学
    包膜表面糖蛋白gp160前体 环境价值 TSPO以剂量依赖性方式抑制293T细胞中HIV-1 Env的表达 公共医学
    包膜跨膜糖蛋白gp41 环境价值 用TSPO拮抗剂治疗或shRNA敲除TSPO通过恢复HIV-1 gp120/gp41的生物发生激活非许可NKR细胞中HIV-1的复制 公共医学

    转到HIV-1人类交互数据库

    PubChem的途径

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    互动

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    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

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    标记

    同源性

    基因本体论 GOA提供

    功能 证据代码 酒吧
    启用雄激素结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    启用苯二氮卓受体活性 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    能够结合胆固醇 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    能够结合胆固醇 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    促进胆固醇转移活性 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		  
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    		 公共医学 
    实现跨膜转运蛋白结合 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    过程 证据代码 酒吧
    参与C21-类固醇激素生物合成过程 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		  
    参与肾上腺发育 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与疼痛的行为反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与细胞低张反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与细胞对脂多糖的反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与细胞对锌离子的反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与氯离子运输 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与胆固醇稳态 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与接触抑制 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与胶质细胞迁移 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与血红素生物合成过程 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    参与膜间脂质转运 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与线粒体蛋白质定位的维持 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与单原子阴离子转运 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    参与ATP代谢过程的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与皮质酮分泌的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与胶质细胞增殖的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与有丝分裂的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与一氧化氮生物合成过程的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与蛋白质泛素化的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与肿瘤坏死因子产生的负调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与周围神经系统轴突再生 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与细胞凋亡过程的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与钙离子转运的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与胶质细胞增殖的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与线粒体去极化的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与程序性坏死细胞死亡的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与活性氧代谢过程的正调控 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    靶向线粒体的参与蛋白 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    参与细胞群体增殖的调控 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    胆固醇转运的调控 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    参与类固醇生物合成过程的调节 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与乙酰胆碱反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    锰离子参与反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与孕酮反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与睾酮反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与维生素B1反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与对外来刺激的反应 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    参与类固醇代谢过程 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		 公共医学 
    参与甾醇转运 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
    		  
    组件 证据代码 酒吧
    定位于胞浆中 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		  
    内质网内is_active 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    定位于胞外外体 HDA公司 公共医学 
    定位于细胞内膜结合细胞器 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		  
    膜内活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
    		  
    定位于线粒体外膜 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
    		  
    位于线粒体内 国际开发协会
    根据直接分析推断
    更多信息
    		  

    一般蛋白质信息

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    首选名称
    易位蛋白
    姓名
    苯二氮卓外周结合位点
    线粒体苯二氮卓受体
    外周型苯二氮卓受体

    NCBI参考序列（RefSeq）

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    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_000714.6号→NP_000705.2号易位蛋白

      参见NP_000705.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已审阅

      描述
      转录变体：这种变体（PBR）由四个外显子组成，编码蛋白PBR。
      源序列
      AF075589、BC001110、BP420304
      共识CDS
      CCDS33661.1号文件
      UniProtKB/瑞士Prot
      第30536页,Q53Y59号,问题6ICF9,Q96TF6型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题13850
      相关的
      ENSP00000338004.3号文件,ENST00000337554.8号
      保守领域（1）总结
      pfam03073型
      位置：12→155
      TspO_MBR；TspO/MBR系列

    2. 纳米_001256530.1→NP_001243459.1号易位蛋白

      参见NP_001243459.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已审阅

      描述
      转录变异体：与变异体PBR相比，该变异体（3）在5'UTR中不同。变异体PBR、3和4编码相同的蛋白质。
      源序列
      AF075590、BC001110、BG750685
      共识CDS
      邮编33661.1
      UniProtKB/瑞士Prot
      第30536页,Q53Y59号,问题6ICF9,Q96TF6型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题13850
      相关的
      ENSP0000379563.4号,ENST00000396265.4号
      保守领域（1）总结
      pfam03073型
      位置：12→155
      TspO_MBR；TspO/MBR系列

    3. 纳米_001256531.1→NP_001243460.1易位蛋白

      参见NP_001243460.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态：已审阅

      描述
      转录变异体：与变异体PBR相比，该变异体（4）在5'UTR中不同。变异体PBR、3和4编码相同的蛋白质。
      源序列
      AF075590、BC001110、BG749252
      共识CDS
      CCDS33661.1号文件
      UniProtKB/瑞士Prot
      第30536页,Q53Y59号,问题6ICF9,Q96TF6型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      问题13850
      相关的
      ENSP0000328973.4号,ENST00000329563.8号机组
      保守领域（1）总结
      pfam03073型
      位置：12→155
      TspO_MBR；TspO/MBR系列

    核糖核酸

    1. 编号：046308.2RNA序列

      状态：已审阅

      描述
      转录变体：与变体1相比，该变体（PBR-S）缺少一个内部外显子。这个变体被表示为非编码，因为与变体PBR相比，最长的可用开放阅读框架位于不同的框架中，并且没有实验支持预测蛋白的存在。该转录本已在PMID:8307574中描述。
      源序列
      AF075589、BC001110、L21950
      相关的
      ENST00000583777.5号

    注释基因组的参考序列：GCF_000001405.40-RS_2023_10

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCh38.p14一次组件

    基因组学

    1. NC_000022.11参考GRCh38.p14初级组件

      范围
      43151559.43163242
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

    mRNA和蛋白质

    1. XM_047441479.1号→XP_047297435.1号转运蛋白异构体X1

      UniProtKB/瑞士Prot
      第30536页,Q53Y59号,问题6ICF9,第96季度第6季度

    备选T2T-CHM13v2.0

    基因组学

    1. NC_060946.1替代T2T-CHM13v2.0

      范围
      43632715..43644077
      下载
      GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

    mRNA和蛋白质

    1. XM_054325888.1号→XP_054181863.1号易位蛋白亚型X1

    抑制的参考序列

    以下参考序列已被抑制。解释

    1. NM_007311.3号：抑制的序列

      描述
      NM_007311.3：此RefSeq被永久抑制，因为目前支持转录物，但不支持蛋白质。
    核苷酸 蛋白质
    标题 访问和版本
    蛋白质接入 链接
    GenPept链接 UniProtKB链接
    第30536.3页 GenPept公司 UniProtKB/Swiss-Prot:P30536

    基因链接输出

    以下内容链接输出资源由外部提供者提供。这些提供者负责维护链接。

    化学品信息
    分子生物学数据库
    研究材料
    工具
    其他