Map1lc3b微管相关蛋白1轻链3β[褐家鼠（挪威大鼠）]-基因-NCBI

总结

官方符号: 地图1lc3b由提供RGD公司
官方全名: 微管相关蛋白1轻链3β由提供RGD公司
主要来源: RGD:621315
请参阅相关: 联盟基因组：RGD:621315
基因类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 临时的
有机体: 褐家鼠
血统: 真核生物；后生动物；脊索动物；克兰亚塔；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；闪光；啮齿动物；肌形态；鼠形目；鼠科；穆里奈；大鼠
也称为: LC3B；Mpl3；zbs559；地图1lc3
总结: 实现微管结合活性和蛋白结构域特异性结合活性。参与蛋白质结合活性的正向调节。位于多种细胞成分中，包括自噬体膜；枝晶；和神经元细胞体。微管相关复合体的一部分。与包括MAP1LC3B（微管相关蛋白1轻链3β）在内的几个人类基因同源。【由基因组资源联盟提供，2022年4月】
表达式: 心脏（RPKM 556.0）、肾脏（RPKM504.5）和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
直系同源: 人类鼠标全部的
新款: 尝试新的基因表
尝试新的成绩单表

基因组背景

地点：: 2012年第19季度

外显子计数：: 5

注释发布	状态	装配	Chr公司	位置
RS_2024_02号	现在的	GRCr8型(GCF_036323735.1号)	19	NC_086037.1（66571631..66582270）
RS_2023_06版本	上一个程序集	额定BN7.2(GCF_015227675.2号)	19	NC_051354.1（49665795.49673655）
106	上一个程序集	雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5)	19	NC_005118.4（53635449..53643970）

染色体19-NC_086037.1 描述邻近基因的基因组背景

基因组区域、转录物和产物

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基因组序列：

转到核苷酸： 绘图美国金融服务贸易协会 GenBank（基因银行）

表达式

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项目名称：跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
描述：从Fischer 344大鼠的11个器官（肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫）中分离出320个RNA样本，这些器官来自于四个发育阶段（2-、6-、21-和104周龄）的雌雄大鼠
生物项目：项目编号：238328
出版物：采购价格指数24510058
分析日期：2016年6月6日星期一17:44:12

参考文献

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PubMed中的相关文章

高氧介导的LC3B活化导致II型肺泡上皮细胞（AECII）向I型细胞（AECI）的转分化受损。张磊，等临床实验药理学，2016年9月，PMID 27187184
LC3结合受损线粒体上的外化心磷脂以信号神经元的有丝分裂：对帕金森病的影响。楚CT，等.自噬，2014年2月PMID 24351649，免费PMC文章
新生大鼠支气管肺发育不良CHOP和LC3B表达增加。李明，等国际分子医学杂志，2018年9月，PMID 29901175
使用新型LC3B和p62 TR-FRET测定法定量自噬。布雷西亚尼A，等《公共科学图书馆·综合》，2018年。PMID 29554128，免费PMC文章
大鼠LC3A和LC3B的分子克隆和表征——两种新的自噬体标记物。吴杰，等生物化学与生物物理研究委员会，2006年1月6日。PMID 16300744

查看PubMed中的所有（35）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？

MR409是一种对温度敏感的活性氧反应水凝胶，通过抑制分泌性自噬途径改善大鼠椎间盘退变。
标题：一种热敏性、活性氧反应性、MR409胶囊水凝胶通过抑制分泌性自噬途径改善大鼠椎间盘退变。
线粒体ALDH2抑制高糖诱导的新生大鼠心脏成纤维细胞增殖，其作用可能是通过上调自噬相关蛋白Beclin-1和LC3B介导的。
标题：【线粒体醛脱氢酶2对高糖培养的新生大鼠心肌成纤维细胞自噬相关蛋白的影响】。
CHOP和LC3BII可能共同参与支气管肺发育不良的发生和发展。
标题：新生大鼠支气管肺发育不良中CHOP和LC3B的表达增加。
使用新型LC3B和p62 TR-FRET分析定量自噬。
标题：使用新型LC3B和p62 TR-FRET分析量化自噬。
高氧诱导活化LC3B在AECII转分化中的新作用
标题：高氧介导的LC3B激活导致II型肺泡上皮细胞（AECII）向I型细胞（AECI）的转分化受损。
微管相关蛋白1轻链3与心磷脂结合。防止这种相互作用抑制鱼藤酮诱导的线粒体向自噬体的传递
标题：LC3结合受损线粒体上的外化心磷脂，以信号神经元的有丝分裂：对帕金森病的影响。
自噬蛋白LC3/GABARAP家族的脂质过氧化依赖于Atg3中的膜曲率敏感域。
标题：自噬蛋白LC3/GABARAP家族的脂质过氧化依赖于Atg3中的膜曲率敏感域。
数据表明，钙树突蛋白通过与微管组分轻链3（Mpl3）的相互作用而与微管细胞骨架特异性结合。
标题：钙调蛋白而非钙调蛋白与MAP1A/B轻链3结合：与微管细胞骨架的关联突出了神经元Ca（2+）传感器蛋白的专属结合伙伴。

提交：新基因RIF 更正

PubChem的途径

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互动

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产品	交互作用剂	其他基因	综合体	来源	酒吧	描述

一般基因信息

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标记

RH128740（电子PCR）
- 大学：212048

Map1lc3b（e-PCR），检测多态性
- 大学：536421

同源性

NCBI正交测井

OrthoDB的Orthologs

克隆名称

MGC93422型

基因本体论 RGD提供

功能	证据代码	酒吧
启用神经酰胺绑定	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
启用微管绑定	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
启用微管绑定	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学
使磷脂酰乙醇胺结合	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
使磷脂酰乙醇胺结合	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
实现蛋白质域特异性结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
启用微管蛋白结合	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学
使泛素蛋白连接酶结合	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
使泛素蛋白连接酶结合	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息

过程	证据代码	酒吧
参与自噬体组装	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与自噬体成熟	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与自噬体成熟	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
参与自噬	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
参与线粒体自噬	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与细胞对氮饥饿的反应	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
参与细胞对饥饿的反应	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
参与细胞对饥饿的反应	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
acts上游建立细胞定位	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
参与宏观自噬	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
参与有丝分裂	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
参与有丝分裂	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
粘液分泌上游活动	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
acts_upstream_of_or内粘液分泌的正调节	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息

组件	证据代码	酒吧
定位于自体溶酶体	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位于自噬体	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
自噬体膜中的is_active_	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于自噬体膜中	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学
位于自噬体膜中	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
位于轴突中	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学
定位于轴丝	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位于细胞质小泡	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位于细胞质小泡	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
定位于细胞骨架	国际能源署从电子注释推断更多信息
在枝晶中定位	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学
定位内膜系统	国际能源署从电子注释推断更多信息
定位于细胞内膜结合细胞器	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位膜	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
位于微管内	国际能源署从电子注释推断更多信息
部分微管相关复合物	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学
定位于线粒体膜	国际能源署从电子注释推断更多信息
位于线粒体内	国际标准化组织从序列正畸学推断更多信息
定位于神经元细胞体	伊达根据直接分析推断更多信息	公共医学

一般蛋白质信息

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首选名称: 微管相关蛋白1A/1B轻链3B

姓名: MAP1轻链3样蛋白2; MAP1A/1B轻链3 B; MAP1A/MAP1B LC3 B; MAP1A/MAP1B轻链3 B; 自噬相关蛋白LC3 B; 自噬相关泛素样修饰物LC3B; 微管相关蛋白1A/1B轻链3

NCBI参考序列（RefSeq）

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新款 尝试新的成绩单表

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

mRNA和蛋白质

NM_022867.2号→NP_074058.2号微管相关蛋白1A/1B轻链3B

参见NP_074058.2的相同蛋白质及其注释位置

状态：暂定

源序列

AY392036年

UniProtKB/TrEMBL公司

A0A0G2K9Q7型,A6IZP8型

保守领域（1）总结

cd17235
地点：5→119

Ubl_ATG8_MAP1LC3B；微管相关蛋白1轻链3B（MAP1LC3B）中发现的泛素样（Ubl）结构域

注释基因组的参考序列：GCF_036323735.1-RS_2024_02

以下部分包含属于特定基因组构建。解释

参考GRCr8

基因组学

NC_086037.1参考GRCr8

范围

66571631..66582270

下载

GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

XM_017601351.2号→XP_017456840.1号微管相关蛋白1A/1B轻链3B亚型X2

UniProtKB/瑞士Prot

Q62625问题,问题6XVN7

UniProtKB/TrEMBL公司

A0A0G2K9Q7型,a6zp7

保守领域（1）总结

cd01611号
地点：7→120

GABARAP；GABA受体相关蛋白的泛素结构域
XM_063278272.1→XP_063134342.1号微管相关蛋白1A/1B轻链3B亚型X1