HMGA1高迁移率组AT-hook 1[智人（人类）]-基因-NCBI

总结

官方符号: HMGA1型由提供HGNC公司
官方全名: 高移动性组AT挂钩1由提供HGNC公司
主要来源: HGNC:HGNC:5010
请参阅相关: 乐团：ENSG00000137309 MIM:600701；联盟基因组：HGNC:5010
基因类型: 蛋白质编码
RefSeq状态: 检验过的
有机体: 智人
血统: 真核生物；后生动物；脊索动物；颅亚目；脊椎动物；真造口术；哺乳动物；Eutheria；尤阿古托格利尔斯；灵长类；Haplorhini；卡塔里尼；人科；人类
也称为: HMG-R；HMGIY；HMGA1A型
总结: 该基因编码一种染色质相关蛋白，参与基因转录的调节、逆转录病毒与染色体的整合以及癌细胞的转移进程。编码的蛋白质优先与双链DNA中富含AT的区域的小凹槽结合。已发现该基因编码不同亚型的多个转录变体。该基因的假基因已在多条染色体上鉴定出来。[由RefSeq提供，2016年1月]
表达式: 在淋巴结（RPKM 58.3）、骨髓（RPKM57.3）和23个其他组织中广泛表达查看更多
直系同源: 鼠标全部的
新款: 尝试新的基因表
尝试新的成绩单

基因组背景

位置：: 第61.31页

外显子计数：: 6

注释发布	状态	装配	Chr公司	位置
2003年10月10日	现在的	GRCh38.p14型(GCF_000001405.40)	6	NC_000006.12（34236873..34246231）
2003年10月10日	现在的	T2T-CHM13v2.0(GCF_009914755.1号)	6	NC_060930.1（34060576..34069936）
105.20220307	上一个程序集	GRCh37.p13型(合同通用条款000001405.25)	6	NC_000006.11（34204650..34214008）

染色体6-NC_000006.12 描述邻近基因的基因组背景

基因组区域、转录物和产物

转到页面顶部帮助

去参考序列详细信息

基因组序列：

转到核苷酸： 绘图美国金融服务贸易协会 GenBank（基因银行）

表达式

转到页面顶部帮助

查看详细信息

项目名称：HPA RNA-seq正常组织
描述：对代表27种不同组织的95名人类个体的组织样本进行RNA-seq，以确定所有蛋白编码基因的组织特异性
生物项目：项目编号：4337
出版物：项目管理标识号24309898
分析日期：2018年4月4日星期三07:08:55

参考文献

转到页面顶部帮助

PubMed中的相关文章

靶向HMGA1有助于侵袭性乳腺癌的免疫治疗，同时抑制EMT。昌X，等生物化学药理学，2023年6月，PMID 37146833
HMGA1与肝细胞癌免疫抑制的相关性：一项综合生物信息学分析。朱军，等《医学》（巴尔的摩），2023年1月27日。PMID 36705364，免费PMC文章
HMGA1调节乳腺癌细胞中复制依赖性组蛋白基因和细胞周期的表达。 Petrosino S公司，等《国际分子科学杂志》，2022年12月29日。PMID 36614035，免费PMC文章
二甲双胍在男性生殖肿瘤SEM-1细胞系中的抗癌作用由HMGA1介导。萨拉蒂诺A，等.Front Endocrinol（洛桑），2022。PMID 36506071，免费PMC文章
HMGA1通过JMJD3/ZEB1轴加重IL-1β诱导的初级软骨细胞的氧化应激损伤和炎症反应。艾J，等《国际过敏免疫学杂志》，2023年。PMID 36470235号

查看PubMed中的所有（401）引文

GeneRIFs：功能的基因引用

什么是GeneRIF？

m6A介导的lncRNA NEAT1通过结合miR-361-3p上调HMGA1的表达，在非小细胞肺癌中发挥致癌作用。
标题：m6A介导的lncRNA NEAT1通过结合miR-361-3p上调HMGA1表达，在非小细胞肺癌中发挥致癌作用。
TFAP2A激活HMGA1促进糖酵解和肺腺癌进展。
标题：TFAP2A激活HMGA1促进糖酵解和肺腺癌进展。
蛋白质组学筛选发现HMGA1是一种很有希望的γ-球蛋白表达负调控因子，以应对β-球蛋白水平的降低。
标题：蛋白质组学筛选发现HMGA1是一种有希望的γ-珠蛋白表达负调控因子，以应对β-珠蛋白水平下降。
靶向HMGA1有助于侵袭性乳腺癌的免疫治疗，同时抑制EMT。
标题：靶向HMGA1有助于侵袭性乳腺癌的免疫治疗，同时抑制EMT。
HMGA1诱导FGF19促进胰腺癌发生和基质形成。
标题：HMGA1诱导FGF19驱动胰腺癌变和间质形成。
HMGA1通过JMJD3/ZEB1轴加重IL-1β诱导的初级软骨细胞的氧化应激损伤和炎症反应。
标题：HMGA1通过JMJD3/ZEB1轴加剧IL-1β诱导的初级软骨细胞的氧化应激损伤和炎症反应。
长非编码RNA MYU通过海绵miR-6827-5p和上调HMGA1促进卵巢癌细胞增殖。
标题：长非编码RNA MYU通过海绵miR-6827-5p和上调HMGA1促进卵巢癌细胞增殖。
HMGA1与肝细胞癌免疫抑制的相关性：一项综合生物信息学分析。
标题：HMGA1与肝细胞癌免疫抑制之间的关系：一项综合生物信息学分析。
ST8SIA6-AS1通过靶向miR-142-3p/HMGA1轴促进肝细胞癌的进展。
标题：ST8SIA6-AS1通过靶向miR-142-3p/HMGA1轴促进肝细胞癌进展。
肥大细胞通过抑制HMGA1的分泌而损害黑色素瘤细胞的归巢和转移。
标题：肥大细胞通过抑制HMGA1分泌而损害黑色素瘤细胞的归巢和转移。

提交：新GenerRIF 更正查看所有GenerRIF（218）

表型

转到页面顶部帮助

在NIH基因检测注册中心（GTR）查找该基因的测试

使用PheGenI回顾该区域的eQTL和表型关联数据

描述	测验
2型糖尿病 MedGen公司：C0011860号 OMIM公司：125853 基因审查：WFS1频谱紊乱	比较实验室

EBI GWAS目录

描述
对19633名日本受试者进行的全基因组关联研究确定LHX3-QSOX2和IGF1为成人身高基因座。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
一项针对亚洲人群的大规模全基因组关联研究揭示了影响八个数量性状的遗传因素。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
对249796名个体的关联分析揭示了18个与体重指数相关的新位点。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
澳大利亚双胞胎家庭身高和体重指数的全基因组关联研究。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
全基因组荟萃分析确定了11个人体测量特征的新位点，并为遗传结构提供了见解。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
成百上千的变异聚集在基因组位点和生物途径中影响人类身高。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
韩国人群中影响身高的15个基因座的鉴定。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
非洲血统个体成人身高相关基因座的鉴定、复制和精细定位。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
影响成人身高多样性的许多序列变异。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
东亚成人身高全基因组关联研究的Meta分析确定了17个新基因座。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学
成人身高全基因组扫描的荟萃分析确定了新的基因座以及与骨骼框架尺寸测量的关联。 EBI GWAS目录 EBI GWAS目录公共医学

变更

转到页面顶部帮助

基因型

HIV-1相互作用

转到页面顶部帮助

蛋白质相互作用

蛋白质	基因	互动	酒吧
塔特	塔特	HMGA1在体外与HIV-1 Tat竞争TAR结合。HMGA1与TAR的相互作用由蛋白质的第一个N末端A/T钩基序介导	公共医学
	塔特	HIV-1 Tat与HMGA1在T细胞中的相互作用通过基于亲和色谱和质谱的蛋白质组学策略进行鉴定	公共医学
整合酶	插科打诨	HMGIY是HIV-1整合前复合物的组成部分，通过促进活性HIV-1整合酶cDNA复合物的形成来刺激整合	公共医学
矩阵	堵住	HIV-1矩阵与HIV-1预整合复合体中存在的HMG I（Y）相关	公共医学

转到HIV-1人类交互数据库

PubChem的途径

转到页面顶部

互动

转到页面顶部帮助

产品	交互作用者	其他基因	复杂	来源	酒吧	描述

一般基因信息

转到页面顶部帮助

标记

G11813（e-PCR）
- 大学：77671

MARC_1047-1048:991929773:1（电子PCR）
- 大学：230835

RH46847（电子聚合酶链式反应）
- 大学：90097

同源性

NCBI正交测井

克隆名称

MGC4242、MGC4854、MGC12816

基因本体论 GOA提供

功能	证据代码	酒吧
启用DNA绑定	经验根据实验推断更多信息	公共医学
启用DNA绑定	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
支持DNA结合、弯曲	经验根据实验推断更多信息	公共医学
启用RNA结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使RNA聚合酶II顺调控区序列特异性DNA结合	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
启用染色质结合	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
实现顺调控区序列特异性DNA结合	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
启用酶结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使富含腺嘌呤胸腺嘧啶的DNA结合形成小凹槽	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
使富含腺嘌呤-胸腺嘧啶的DNA结合形成小凹槽	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
使富含腺嘌呤-胸腺嘧啶的DNA结合形成小凹槽	TAS公司可追溯作者声明更多信息	公共医学
启用分子适配器活动	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
启用分子功能激活剂活性	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
激活核受体辅活化因子	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
使核维甲酸受体结合	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
使核维甲酸X受体结合	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
使过氧化物酶体增殖物激活受体结合	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
实现蛋白质结合	IPI公司从物理相互作用推断更多信息	公共医学
使染色质的结构成分成为可能	TAS公司可追溯作者声明更多信息	公共医学
激活转录辅激活子活性	经验根据实验推断更多信息	公共医学
激活转录辅激活子活性	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
激活转录辅激活子活性	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
激活转录协同调节活性	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
启用转录协同调节因子结合	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学

过程	证据代码	酒吧
参与DNA复制的DNA解旋	北美不可追踪的作者声明更多信息	公共医学
参与DNA模板转录的负调控	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
参与细胞群体增殖的负调控	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
参与核小体解体	TAS公司可追溯作者声明更多信息	公共医学
肿瘤诱导的细胞衰老	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
参与DNA模板转录的正调控	进口根据突变表型推断更多信息	公共医学
参与RNA聚合酶II对转录的正调控	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
参与DNA模板转录的调节	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息

组件	证据代码	酒吧
部分RNA聚合酶II转录调节复合物	国际空间站根据序列或结构相似性推断更多信息
定位于胞浆中	TAS公司可追溯作者声明更多信息
局部粘着	HDA公司更多信息	公共医学
核质定位	TAS公司可追溯作者声明更多信息
位于核内	HDA公司更多信息	公共医学
在核心中是活动的	国际律师协会从祖先的生物学角度推断更多信息
位于核内	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
衰老相关异染色质焦点部分	国际开发协会根据直接分析推断更多信息	公共医学
部分转录调节复合物	TAS公司可追溯作者声明更多信息	公共医学

一般蛋白质信息

转到页面顶部帮助

首选名称: 高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y

姓名: 高迁移率族蛋白A1; 高迁移率族蛋白R; 非组蛋白染色体高迁移率组蛋白HMG-I/HMG-Y

NCBI参考序列（RefSeq）

转到页面顶部帮助

新款 尝试新的成绩单

独立于注释的RefSeq维护基因组

这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

这些参考序列与基因组无关注释循环，因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域，成绩单和产品以上。

基因组学

NG_029020.1参考序列基因

范围

5074.14432

下载

GenBank（基因银行）,美国金融服务贸易协会,序列查看器（图形）

mRNA和蛋白质

NM_001319077.2→NP_001306006.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型b

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（8）在5'UTR中使用备用拼接位点，并使用备用帧内拼接位点。它编码亚型b（也称为HMG-Y），比亚型a短。变体2、4、5、7和8编码相同的亚型（b）。

源序列

AL354740、BC008832、DA049639、M23616

共识CDS

CCDS4788.1号

UniProtKB/TrEMBL公司

Q5T6U8型
NM_001319078.2号→NP_001306007.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型a

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（9）在5'UTR中缺少外显子。变体1、3、9、10、12和13编码亚型（a，也称为HMG-I）。

源序列

AL354740、BC008832、BC063434、DA049639

共识CDS

CCDS4789.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第10910页,第17096页,Q5T6U9型,Q9UKB0号机组
纳米_001319079.2→NP_001306008.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型a

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（10）在5'UTR中使用了一个备用剪接位点。变体1、3、9、10、12和13编码亚型（a，也称为HMG-I）。

源序列

AL354740、BC008832、DA467015

共识CDS

CCDS4789.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第10910页,第17096页,第5季度,Q9UKB0号机组
NM_001319080.2→NP_001306009.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型c

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（11）使用了一个替代的帧内拼接位点。编码的亚型（c）比亚型a短。

源序列

AL354740、BC008832、DA049639、DA936387

共识CDS

CCDS93895.1标准

UniProtKB/TrEMBL公司

A0A994J434型

相关的

ENSP0000515486.1标准,ENST00000703808.1标准
NM_001319081.2→NP_001306010.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型a

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（13）使用了另一个剪接位点，在5'UTR中缺少外显子。变体1、3、9、10、12和13编码亚型（a，也称为HMG-I）。

源序列

AL354740、BC008832、CX785762、DA049639

共识CDS

CCDS4789.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第10910页,第17096页,Q5T6U9型,Q9UKB0号机组
NM_001319082.2号→NP_001306011.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型a

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（12）在5'UTR中使用了一个备用剪接位点。变体1、3、9、10、12和13编码亚型（a，也称为HMG-I）。

源序列

AL354740、BC008832、BE269847、DB029421

共识CDS

邮编：4789.1

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第10910页,第17096页,Q5T6U9型,Q9UKB0号机组
NM_002131.4号→NP_002122.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型b

参见NP_002122.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变异体：与变异体1相比，该变异体（2）使用了一个交替的框内剪接位点，导致了比同种异体a更短的同种异体（b，也称为HMG-Y）。变异体2、4、5、7和8编码相同的同种异体（b）。

源序列

AL354740、BC004924、BC008832、DA049639

共识CDS

CCDS4788.1号

UniProtKB/TrEMBL公司

Q5T6U8型

相关的

ENSP0000385693.2标准,ENST00000401473.7标准
NM_145899.3→NP_665906.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型a

参见NP_665906.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变体：这个变体（1）代表最长的转录并编码较长的亚型（a，也称为HMG-I）。变体1、3、9、10、12和13编码亚型（a）。

源序列

AL354740、BC008832、DA049639

共识CDS

CCDS4789.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第10910页,第17096页,Q5T6U9型,Q9UKB0号机组

相关的

ENSP0000308227.4号文件,ENST00000311487.9
NM_145901.3→NP_665908.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型a

参见NP_665908.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

成绩单变体：与变体1相比，该变体（3）在5'UTR上有所不同。变体1、3、9、10、12和13编码亚型（a，也称为HMG-I）。

源序列

AL354740、BC008832、DA574958、DC374225、M23614

共识CDS

CCDS4789.1号文件

UniProtKB/Swiss-Prot公司

第10910页,第17096页,Q5T6U9型,Q9UKB0号机组

相关的

ENSP000039988.1号机组,ENST00000447654.5号
NM_145902.3号→NP_665909.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型b

参见NP_665909.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变异体：与变异体1相比，该变异体（4）在5'UTR上不同，并使用了一个交替的框内剪接位点。它编码亚型b（也称为HMG-Y），比亚型a短。变体2、4、5、7和8编码相同的亚型（b）。

源序列

AL354740、BC008832、DA574958、DC374225、M23615

共识CDS

CCDS4788.1号

UniProtKB/TrEMBL公司

Q5T6U8型
NM_145903.3号→NP_665910.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型b

参见NP_665910.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（5）在5'UTR中缺乏外显子，并且使用了一个交替的框内剪接位点。它编码亚型b（也称为HMG-Y），比亚型a短。变体2、4、5、7和8编码相同的亚型（b）。

源序列

AL354740、BC008832、DC338100、M23617

共识CDS

CCDS4788.1号

UniProtKB/TrEMBL公司

Q5T6U8型

相关的

ENSP0000288245.9号,ENST00000347617.10标准
NM_145905.3→NP_665912.1号高迁移率族蛋白HMG-I/HMG-Y亚型b

参见NP_665912.1的相同蛋白质及其注释位置

状态：已审阅

描述

转录变体：与变体1相比，该变体（7）在5'UTR中有所不同，并使用了一个替代的帧内拼接位点。它编码亚型b（也称为HMG-Y），比亚型a短。变体2、4、5、7和8编码相同的亚型（b）。

源序列

AL354740、BC008832、BC015789

共识CDS

CCDS4788.1号

UniProtKB/TrEMBL公司

Q5T6U8型

相关的

ENSP00000363230.3号文件,ENST00000374116.3标准