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    第4列2IV型胶原α2链[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:306628,更新日期2024年4月13日

    总结

    官方符号
    第4a2列由提供RGD公司
    官方全名
    IV型胶原α2链由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:1308085号
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000023972 联盟基因组:RGD:1308085
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    总结
    预测为细胞外基质结构成分。参与衰老和对活动的反应。预计位于基底膜。预计为IV型胶原三聚体的一部分。预计活跃于细胞外基质和细胞外间隙。与动脉粥样硬化相关的该基因的人类同源基因;脑小血管病2例;和脑穿孔。与人COL4A2同源(IV型胶原α2链)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    心脏(RPKM 790.7)、肺(RPKM732.5)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单

    基因组背景

    位置:
    16q12.5型
    外显子计数:
    48
    注释发布 状态 装配 氯代甲烷 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8级(GCF_036323735.1号) 16 NC_086034.1(84749672..84885520,补码)
    RS_2023_06号 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 16 NC_051351.1(78047591..78183360,补遗)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 16 NC_005115.4(83386388..83522169,补体)

    染色体16-NC_086034.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC102553902 Neighboring gene NAD(P)HX dehydratase Neighboring gene RAB20, member RAS oncogene family Neighboring gene collagen type IV alpha 1 chain Neighboring gene uncharacterized LOC134482537 Neighboring gene uncharacterized LOC120097569

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:38328年4月
    • 出版物:PMID 24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    GeneRIFs:功能中的基因参考

    什么是GeneRIF?
    提交: 新GenerRIF 更正

    PubChem的途径

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    使细胞外基质结构成分具有抗拉强度 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    启用分子适配器活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    组件 证据代码 酒吧
    基底膜中的活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位于基底膜 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    部分IV型胶原三聚体 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    部分IV型胶原三聚体 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    位于细胞外区域 TAS公司
    可追溯作者声明
    更多信息
     
    在细胞外空间活动 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    定位膜 国际能源署
    从电子注释推断
    更多信息
     

    一般蛋白质信息

    首选名称
    胶原蛋白α-2(IV)链
    姓名
    Ⅳ型α-2胶原
    胶原蛋白,IV型,α2
    前胶原,IV型,α2

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001427256.1NP_001414185.1胶原蛋白α-2(IV)链前体

      状态:已验证

      源序列
      日本宇宙航空研究开发委员会Z01000016
      UniProtKB/TrEMBL公司
      2016财年第3季度

    注释基因组参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086034.1参考GRCr8

      范围
      84749672..84885520补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)