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    GFAP胶质纤维酸性蛋白智人(人)

    基因ID:2670,更新于21月1日至2020年

    概要

    官方符号
    GFAP提供的HGNC
    官方全名
    胶质纤维酸性蛋白提供的HGNC
    主要来源
    HGNC:HGNC:4235
    见相关
    Engbl:Engg000 0131395 MIM:137780
    基因型
    蛋白质编码
    RefSEQ状态
    检验过的
    有机体
    智人
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;Craniata;脊椎动物;Euteleostomi;Mammalia;真皮;Euarchontoglires;灵长类动物;Haplorrhini;Catarrhini;Hominidae;HOMO。
    也称为
    AlxDRD
    概要
    该基因编码成熟星形胶质细胞的主要中间丝蛋白之一。它是一种标记,以区分星形胶质细胞与其他神经胶质细胞在发育过程中。这种基因的突变导致亚力山大病,这是中枢神经系统中罕见的星形胶质细胞疾病。选择性剪接导致多个转录变体编码不同的亚型。[ RefSeq,OCT 2008提供]
    表情
    对大脑的限制性表达(RPKM 1208.4)查看更多
    直系同源

    基因组背景

    位置
    17Q21.31
    外显子计数:
    注释发布 地位 装配 CHR 位置
    一百零九点二零一九一二零五 现在的 GRCH30.P13GCFY0000 01405.39 十七 NCY0.00 1711(44903159…44915552,补体)
    一百零五 以前的装配 GRCH37.P13GCFY0000 01405.25 十七 NCY0.00 1710(42982994…42992920,补体)

    17号染色体NCY000描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene HIG1 hypoxia inducible domain family member 1B Neighboring gene elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 Neighboring gene RNA, 7SL, cytoplasmic 405, pseudogene Neighboring gene coiled-coil domain containing 103 Neighboring gene family with sequence similarity 187 member A Neighboring gene uncharacterized LOC105371793 Neighboring gene kinesin family member 18B Neighboring gene microRNA 6783

    基因组区域、转录物和产品

    表情

    • 项目名称:HPA RNA SEQ正常组织
    • 描述:从95个代表27个不同组织的人的组织样本中进行RNA SEQ,以确定所有蛋白质编码基因的组织特异性。
    • BioProject:PREJB4337
    • 发表PMED 24309898
    • 分析日期:周五4月4日07:08:55 2018

    参考文献

    基因导入功能

    什么是通用的?

    HIV-1相互作用

    蛋白质相互作用

    蛋白 基因 互动 酒馆
    包膜糖蛋白gp120 埃恩 抗坏血酸补充可防止脑细胞培养中iNOS和相关神经元(MAP2)和星形胶质细胞(GFAP)蛋白表达和结构变化的有害上调。 PubMed
    埃恩 在星形胶质细胞中,HIV-1 GP120部分地阻止了由异丙肾上腺素刺激的两种主要细胞骨架蛋白波形蛋白和GFAP的磷酸化。 PubMed
    埃恩 用HIV-1 GP120治疗人脑组织引起星形胶质细胞的改变和/或死亡,观察到胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达的减少,以及66 kDa的主要蛋白质的减少。 PubMed
    内夫 内夫 HIV-1 NEF在星形胶质细胞中比高血糖降低GFAP的表达 PubMed
    内夫 HIV-1 NEF与星形胶质细胞特异性细胞骨架蛋白GFAP在持续NEF表达的星形胶质细胞中定位,提示NEF和GFAP之间的相互作用可能参与星形胶质细胞的形态和激活状态的改变。 PubMed
    内夫 NEF上调星形胶质细胞胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达水平 PubMed
    达特 达特 HIV-1分支B和C TAT上调GFAP在原代胶质细胞中的表达 PubMed
    达特 HIV-1 TAT在星形胶质细胞中的表达导致胶质纤维酸性蛋白(GFAP)表达的显著增加 PubMed
    达特 HIV-1 TAT诱导上调和STAT3表达的磷酸化导致TAT表达的星形胶质细胞和HIV感染的星形胶质细胞中GFAP、Egr-1、P300转录和蛋白表达的增加。 PubMed
    达特 HIV-1 TAT介导腺病毒E1A相关的300 kDa蛋白P300上调星形胶质细胞GFAP表达的上调 PubMed
    VPR VPR HIV-1 VPR上调星形胶质细胞胞浆中CCR5的表达,使其与GFAP共定位 PubMed
    反胃蛋白酶 加格波尔 HIV-1蛋白酶体外切割中间丝蛋白波形蛋白、结蛋白和胶质纤维酸性蛋白 PubMed

    去HIV-1,人类互动数据库

    蛹的途径

    交互作用

    产品 相互作用物 其他基因 复合物 来源 酒馆 描述

    一般基因信息

    马克笔

    同源性

    克隆名

    • FLJ42474,FLJ45

    基因本体论 果阿邦提供

    功能 证据代码 酒馆
    相同蛋白结合 IPI
    从物理相互作用推断
    更多信息
    PubMedγ
    蛋白质结合 IPI
    从物理相互作用推断
    更多信息
    PubMedγ
    细胞骨架的结构成分 塔斯
    可追溯著者语句
    更多信息
    PubMedγ
    过程 证据代码 酒馆
    中间丝组织 国际开发协会
    直接测定推断
    更多信息
    PubMedγ
    伴侣介导的自噬调控 国际空间站
    从序列或结构相似性推断
    更多信息
    γ
    伴侣介导的自噬调控 塔斯
    可追溯著者语句
    更多信息
    PubMedγ
    蛋白质复合物的调节 塔斯
    可追溯著者语句
    更多信息
    PubMedγ
    组件 证据代码 酒馆
    细胞质 国际开发协会
    直接测定推断
    更多信息
    PubMedγ
    胞质溶胶 塔斯
    可追溯著者语句
    更多信息
    γ
    中间丝 国际能源机构
    从电子注释推断
    更多信息
    γ
    中间丝细胞骨架 国际开发协会
    直接测定推断
    更多信息
    γ
    溶酶体结肠定位 国际空间站
    从序列或结构相似性推断
    更多信息
    γ

    一般蛋白质信息

    首选名称
    胶质纤维酸性蛋白

    NCBI参考序列(ReFSEQ)

    独立于注释的基因组的ReqsQS保持

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组注释周期无关,因此它们的版本可能与当前基因组构建中的RefSEQ版本不匹配。通过将此部分中的ReFSEQ版本与所报告的版本进行比较来识别版本不匹配。基因组区域、转录产物和产物上面。

    基因组

    1. NGY0881.1 1.1反义基因

      范围
      4995…14921
      下载
      基因银行FASTA序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白

    1. NMY01131019.3渐次NPY011244 91.1胶质纤维酸性蛋白亚型2

      现状:回顾

      描述
      转录变体:该变体(2)在3′编码区和3′UTR上不同,与变异体1相比,这导致与同型1相比,具有较短和明显的C-末端的蛋白质(异构体2,也称为同种型ε)。
      源序列(s)
      AJ306407,AK12890,BF52634,DA25492
      共识光盘
      CCSDS47081
      UnPrimkb/瑞士PROT
      P14136
      相关
      EnSP9000404062.1EntS000 000 0435360.7
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次三百七十六
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区
    2. NMY01244672.2渐次NPY01212305.1胶质纤维酸性蛋白亚型3

      现状:回顾

      描述
      转录变体:该变体(3)在3′编码区和3′UTR上不同,与变异体1相比,这导致与同型1相比,具有较短和明显的C-末端的蛋白质(异构体3,也称为异构体Kappa)。
      源序列(s)
      AC015936、BC062609、BF52634、BM68 7259、DA25439、DA315956、DQ97 9832
      共识光盘
      CCSDS 5929
      UnPrimkb/瑞士PROT
      P14136
      UnPurkkb/TrEMBL
      A7RII1
      相关
      EnSP000 000 049 1081.1EntS000 000 0638
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次三百七十六
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区
    3. NMY01363644.1渐次NPY13135075.1胶质纤维酸性蛋白亚型4

      现状:回顾

      源序列(s)
      AC015936
      共识光盘
      CCSDS 86602.1
      相关
      ESPSP0000 02534085EnSt0000 025340810
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次三百七十六
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区
    4. NMY02055.5渐次NPY02044.1胶质纤维酸性蛋白亚型1

      参见NPY020461相同蛋白及其注释位置

      现状:回顾

      描述
      转录变体:此变体(1)代表最长转录物并编码主要的同种型(1,也称为α)。
      源序列(s)
      AC015936,BC013596,BF34 1765,DA25439 2,J0465
      共识光盘
      CCDS11491.1
      UnPrimkb/瑞士PROT
      P14136
      UnPurkkb/TrEMBL
      K7MPO8
      相关
      EnSP9000466992.2EntS000 000 0588 735.3
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次三百七十六
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区

    注释基因组的ReqsQS:智人更新注释109.20191205版

    以下部分包含属于特定基因组构建的参考序列。解释

    参考GRCH38P13主组件

    基因组

    1. NCY0.9001711基准GRCH30.P13主组件

      范围
      44903159…44915552互补
      下载
      基因银行FASTA序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白

    1. XMY024450692.1渐次XP0242430660.1胶质纤维酸性蛋白异构酶X3

      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次四百四十四
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区
    2. XMY024450690.1渐次XP024243064.1胶质纤维酸性蛋白亚型X1

      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次四百四十四
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区
    3. XMY024450691.1渐次XP024243065.1胶质纤维酸性蛋白异构酶X2

      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次四百四十四
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区
    4. XMY024450693.1渐次XP0242430661.1胶质纤维酸性蛋白异构酶X4

      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十八渐次四百四十四
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十六
      中间丝头(DNA结合)区