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    案例3半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3[褐家鼠(挪威鼠)]

    基因ID:25402,更新日期2024年4月11日

    总结

    官方符号
    案例3由提供RGD公司
    官方全名
    半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶3由提供RGD公司
    主要来源
    RGD:2275
    请参阅相关
    乐团:ENSRNOG00000010475 联盟基因组:RGD:2275
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    临时的
    有机体
    褐家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;大鼠
    也称为
    虱子;雅玛;CPP32-β
    总结
    实现多种功能,包括死亡受体结合活性;磷脂酶A2激活剂活性;和蛋白酶结合活性。参与多种过程,包括黄体溶解;神经系统发育;淀粉样β形成的正调控。位于胞浆中;膜筏;和神经元细胞体。死亡诱导信号复合体的一部分。用于研究动脉疾病(多发性);脑病(多发性);和癌前肿瘤。几种疾病的生物标志物,包括动脉疾病(多发性);脑病(多发性);糖尿病(多发);心脏病(多发性);和胰腺炎(多发性)。该基因的人类直系同源基因与帕金森氏病有关;结肠癌;肺非小细胞癌;和胃癌。与人CASP3(caspase 3)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    胸腺(RPKM 222.5)、脾脏(RPKM187.9)和9个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    地点:
    2011年第16季度
    外显子计数:
    8
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCr8型(GCF_036323735.1号) 16 NC_086034.1(52395539..52413794,补码)
    RS_2023_06版本 上一个程序集 额定BN7.2(GCF_015227675.2号) 16 NC_051351.1(45662910..45681171,补码)
    106 上一个程序集 雷诺_6.0(GCF_ 000001895.5) 16 NC_005115.4(48845011..48863249,补遗)

    染色体16-NC_086034.1描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene uncharacterized LOC120097385 Neighboring gene uncharacterized LOC134482506 Neighboring gene ribosomal protein L4, pseudogene 3 Neighboring gene primase and DNA directed polymerase Neighboring gene centromere protein U Neighboring gene acyl-CoA synthetase long-chain family member 1

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:跨越11个器官和4个发育阶段的大鼠RNA-Seq转录体BodyMap
    • 描述:从Fischer 344大鼠的11个器官(肾上腺、大脑、心脏、肾脏、肝脏、肺、肌肉、脾脏、胸腺和睾丸或子宫)中分离出320个RNA样本,这些器官来自于四个发育阶段(2-、6-、21-和104周龄)的雌雄大鼠
    • 生物项目:项目编号:238328
    • 出版物:采购价格指数24510058
    • 分析日期:2016年6月6日星期一17:44:12

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 综合体 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    克隆名称

    • MGC93645型

    基因本体论 RGD提供

    功能 证据代码 酒吧
    激活天冬氨酸型内肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活细胞周期蛋白依赖性蛋白丝氨酸/苏氨酸激酶抑制剂活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活半胱氨酸型内肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡过程 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与凋亡信号通路 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡的执行阶段 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡的执行阶段 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使半胱氨酸型内肽酶活性参与细胞凋亡的执行阶段 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    激活半胱氨酸型肽酶活性 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    激活半胱氨酸型肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使死亡受体结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    激活内肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活内肽酶活性 国际空间站
    根据序列或结构相似性推断
    更多信息
     
    激活酶激活剂活性 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    激活肽酶活性 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    激活磷脂酶A2激活剂活性 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    启用蛋白酶绑定 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    实现含蛋白复合物结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_of_withinB细胞稳态 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within DNA损伤响应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_ T细胞内稳态 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或前神经管闭合内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts上游of或在凋亡过程中 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与轴突束 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or细胞内命运承诺 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞对有机环状化合物的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或细胞内对有机物质的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    staurosporine参与细胞反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    上皮细胞凋亡过程中上游的acts 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与红细胞分化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与红细胞分化 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞凋亡的执行阶段 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or凋亡执行期内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞凋亡的执行阶段 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    成纤维细胞凋亡过程中上游的acts 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与胶质细胞凋亡过程 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    胶质细胞凋亡过程中上游的acts 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    心脏发育的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与海马发育 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞内信号转导 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与内在凋亡信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    渗透胁迫下内源性凋亡信号通路的参与 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与角质形成细胞分化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts上游of或角质形成细胞分化内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与学习或记忆 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与白细胞凋亡过程 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与黄体溶解 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_within B细胞增殖负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or内激活T细胞增殖的负调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within细胞周期负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与细胞因子产生的负调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    神经元凋亡过程中的上游活动 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元分化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与神经元分化 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内神经营养素TRK受体信号通路 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与淀粉样β形成的正调控 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与β淀粉样蛋白形成的阳性调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与凋亡过程的正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与凋亡过程的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与神经元凋亡过程的正调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与神经元凋亡过程的正调控 进口
    由突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与细胞凋亡的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质分解代谢过程 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质分解代谢过程 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质成熟 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    蛋白质加工中的上游行为 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质加工 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质水解 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与蛋白质水解 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质水解 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与性焦下垂 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与蛋白质稳定性的调节 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质稳定性的调节 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_in对紫外线的响应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    涉及X射线反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对氨基酸的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与听觉刺激反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与钴离子反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    与雌二醇反应有关 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与糖皮质激素反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与葡萄糖反应 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    与过氧化氢反应有关 伊达
    根据直接分析推断
    更多信息
    公共医学 
    参与缺氧反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对脂多糖的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    与金属离子反应有关 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与尼古丁反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对有机环状化合物的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    与有机物反应有关 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_of_within对有机物的反应 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    动作_上游_of_或在受伤反应范围内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与对外来刺激的反应 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or或在声音的感官感知范围内 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    参与横纹肌细胞分化 IEP公司
    从表达式模式推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3
    姓名
    CASP-3型
    CPP-32系列
    CPP32β
    Caspase 3,凋亡相关半胱氨酸蛋白酶(ICE-like cysteine protease)
    IRP公司
    SCA-1公司
    SREBP裂解活性1
    凋亡素
    半胱氨酸蛋白酶CPP32
    半胱氨酸蛋白酶p32-beta
    蛋白质Yama
    NP_037054.1号
    XP_006253192.1号
    支出_038950133.1

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_012922.2NP_037054.1号半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶-3

      参见NP_037054.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:暂定

      源序列
      BC081854号
      UniProtKB/瑞士Prot
      第55213页,第70543页,第97699页,第62993号
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6JPM9型
      相关的
      ENSRNOP00000014096.3公司,ENSRNOT00000014095.6号
      保守领域(1)总结
      智能00115
      地点:37277
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白介素-1β转化酶(ICE)同系物

    注释基因组的参考序列:GCF_036323735.1-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCr8

    基因组学

    1. NC_086034.1参考GRCr8

      范围
      52395539..52413794补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_006253130.5号XP_006253192.1号caspase-3亚型X1

      参见XP_006253192.1的相同蛋白质及其注释位置

      UniProtKB/瑞士Prot
      第55213页,第70543页,第97699页,问题62993
      UniProtKB/TrEMBL公司
      A6JPM9型
      保守领域(1)总结
      智能00115
      地点:37277
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白介素-1β转化酶(ICE)同系物
    2. XM_039094205.2号XP_038950133.1型caspase-3亚型X2

      保守领域(1)总结
      第00042条
      地点:37206
      CASc;半胱氨酸天冬氨酸酶、白细胞介素-1β转化酶(ICE)同源物;半胱氨酸依赖性天冬氨酸定向蛋白酶,介导程序性细胞死亡(凋亡)。半胱氨酸天冬氨酸蛋白酶是作为非活性酶原合成的,并通过肽的蛋白水解被激活。。。