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    GFAP胶质纤维酸性蛋白家鼠(家鼠)

    基因ID:14580,更新于5月1日至2020年

    概要

    官方符号
    GFAP提供的MGI
    官方全名
    胶质纤维酸性蛋白提供的MGI
    主要来源
    MGI:MGI:95697
    见相关
    EngBLL:传感器
    基因型
    蛋白质编码
    RefSEQ状态
    验证的
    有机体
    家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;Craniata;脊椎动物;Euteleostomi;Mammalia;Euthista;Euarchontoglires;Glires;啮齿目;Myomorpha;Muroidea;
    也称为
    AI836096
    表情
    小脑成人(RPKM 34.4)、额叶成人(RPKM 32.7)和4个其他组织中的有偏表达查看更多
    直系同源

    基因组背景

    位置
    11 E1;11 66.48厘米
    外显子计数:
    十一
    注释发布 地位 装配 CHR 位置
    一百零八 现在的 GRCM30.P6GCFI000 000 000 1635.26 十一 NCY0.00 77.6(102887336…102897200,补码)
    建立37.2 以前的装配 MGSCV37(MGSCV37)GCFI000 000 000 1635.18 十一 NCY0.00 77.5(102748650…102758514,补体)

    11号染色体NCY000 000 77.6描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene HIG1 domain family, member 1B Neighboring gene elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 Neighboring gene coiled-coil domain containing 103 Neighboring gene family with sequence similarity 187, member A Neighboring gene predicted gene, 34560 Neighboring gene predicted gene, 39395 Neighboring gene kinesin family member 18B

    基因组区域、转录物和产品

    表情

    • 项目名称:小鼠编码转录组数据
    • 描述:由鼠标编码项目生成的RNA轮廓数据集。
    • BioProject:PRJNA66 167
    • 发表PMED 25409824
    • 分析日期:N/A

    参考文献

    基因导入功能

    什么是通用的?

    变异

    等位基因

    这种类型的Alleles被记录在小鼠基因组信息学中。(MGI)

    交互作用

    产品 相互作用物 其他基因 复合物 来源 酒馆 描述

    一般基因信息

    马克笔

    同源性

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒馆
    相同蛋白结合 国际标准化组织
    从序列正字法推断
    更多信息
    γ
    整合素结合 国际标准化组织
    从序列正字法推断
    更多信息
    γ
    激酶结合 国际标准化组织
    从序列正字法推断
    更多信息
    γ
    蛋白质结合 IPI
    从物理相互作用推断
    更多信息
    PubMedγ
    细胞骨架的结构成分 进口
    从Mutant Phenotype推断
    更多信息
    PubMedγ
    细胞骨架的结构成分 国际标准化组织
    从序列正字法推断
    更多信息
    γ

    一般蛋白质信息

    首选名称
    胶质纤维酸性蛋白
    姓名
    中间丝蛋白

    NCBI参考序列(ReFSEQ)

    独立于注释的基因组的ReqsQS保持

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组注释周期无关,因此它们的版本可能与当前基因组构建中的RefSEQ版本不匹配。通过将此部分中的ReFSEQ版本与所报告的版本进行比较来识别版本不匹配。基因组区域、转录产物和产物上面。

    mRNA和蛋白

    1. NMY01131020.1渐次NPY0112492.1胶质纤维酸性蛋白亚型1

      状态:验证

      描述
      转录变体:此变体(1)代表较长的转录物并编码较长的异构体(1)。
      源序列(s)
      AK140151,BC139357,BU7000 210
      共识光盘
      CCSD4950.1
      UnPrimkb/瑞士PROT
      P0399
      相关
      EnsMyP000 000 77061.4奴隶制700 000 77 902.4
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十五渐次三百七十三
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十三
      中间丝头(DNA结合)区
    2. NMY01027.7.3渐次NP0034 407.2胶质纤维酸性蛋白亚型2

      参见NPY034 407.2相同蛋白及其注释位置

      状态:验证

      描述
      转录变体:该变体(2)在3′编码区和3′UTR中不同,与变异体1相比,这导致与异构体1相比,具有较短和明显的C-末端的蛋白质(异构体2)。
      源序列(s)
      AI835063,AK07957 7,BC139357,BE61678,CX223 23
      共识光盘
      CCDS 25507.1
      UnPrimkb/瑞士PROT
      P0399
      相关
      EnsMpp0.000奴隶制000 000 674 44.9
      守恒域(2)概要
      PFAM000 038
      位置六十五渐次三百七十三
      中间丝蛋白
      PFAM0432
      位置渐次六十三
      中间丝头(DNA结合)区

    注释基因组的ReqsQS:MUS肌肉注释108版 详情在新选项卡中打开此链接

    以下部分包含属于特定基因组构建的参考序列。解释

    参考GRCM32.P6C57BL/6J

    基因组

    1. NCY0.00 77.6i参考GRCM30.P6C57BL/6J

      范围
      102887336…102897200互补
      下载
      基因银行FASTA序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白

    1. XMY03024571.1.1渐次XP030301031.1.1胶质纤维酸性蛋白亚型X1

    RNA

    1. XRY38 887.7.4RNA序列