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    Gfap公司胶质纤维酸性蛋白[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:14580,更新日期2024年4月21日

    总结

    官方符号
    Gfap公司由提供MGI公司
    官方全名
    胶质纤维酸性蛋白由提供MGI公司
    主要来源
    MGI:MGI:95697
    请参阅相关
    恩森布尔:ENSMUSG0000020932 联盟基因组:MGI:95697
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    总结
    细胞骨架的一种结构成分。参与调节伴侣介导的自噬。作用于D-天冬氨酸跨膜转运的上游或内部;基因表达;和细胞内蛋白质转运。作用于多个过程的上游或内部,包括中间纤维组织;长时突触增强;和神经发生。位于几个细胞成分中,包括星形胶质细胞端足;细胞体;和中间灯丝。以多种结构表达,包括消化系统;溶血磷脂系统;表皮系统;神经系统;和感觉器官。用于研究亚历山大病。该基因的人类同源基因与亚历山大病有关。与人GFAP(胶质纤维酸性蛋白)同源。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    成人小脑(RPKM 34.4)、成人额叶(RPKM 32.7)和其他4种组织中的偏向性表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    地点:
    11 E1;11 66.48立方厘米
    外显子计数:
    11
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 11 NC_000077.7(102778162..102791368,补体)
    108.20200622 上一个程序集 GRC第38页第6页(GCF_000001635.26号) 11 NC_000077.6(102887336..102897200,补码)

    染色体11-NC_000077.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene elongation factor Tu GTP binding domain containing 2 Neighboring gene CapStarr-seq enhancer MGSCv37_chr11:102742482-102742665 Neighboring gene coiled-coil domain containing 103 Neighboring gene family with sequence similarity 187, member A Neighboring gene predicted gene, 34560 Neighboring gene kinesin family member 18B Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_30821 Neighboring gene complement component 1, q subcomponent-like 1

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:小鼠ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)

    PubChem的途径

    互动

    产品 交互作用者 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    过程 证据代码 酒吧
    acts_upstream_of_or_withinBergmann神经胶质细胞分化 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or_within_positive_effect D-天冬氨酸跨质膜导入 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    施万细胞增殖的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    星形胶质细胞发育中的上游活动 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or细胞外基质组织内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstreamm_of_or_within_positive_effect基因表达 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    涉及中间纤维组织 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    acts _上游_of _或中间纤维组织内 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts _上游_of _或中间纤维组织内 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    涉及中间纤维组织 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts_upstream_of_or_within基于中间丝的工艺 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或within阳性影响细胞内蛋白质转运 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or内长期突触增强 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or对神经元投射发育的负调控 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or对神经元投射发育的负调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    神经元投射发展的上游行为 IGI公司
    从遗传相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    神经元投射发展的上游行为 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts上游of或神经元内投射再生 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    acts_upstream_of_or正调控雪旺细胞增殖 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与胶质细胞增殖的正调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    伴侣介导的自噬调控 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    伴侣介导的自噬调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    伴侣介导的自噬调控 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    acts上游of或调节神经递质摄取 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    胶质纤维酸性蛋白
    姓名
    中间丝蛋白

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列与基因组无关注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来识别版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_001131020.1号NP_001124492.1号胶质纤维酸性蛋白亚型1

      状态:已验证

      描述
      转录变体:该变体(1)代表较长的转录,编码较长的亚型(1)。
      源序列
      AK140151、BC139357、BU700210
      共识CDS
      CCDS48950.1型
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      P03995号
      相关的
      ENSMUSP00000077061.5,ENSMUST00000077902.5
      保守领域(2)总结
      pfam00038型
      地点:65373
      长丝;中间丝蛋白
      pfam04732型
      地点:463
      灯丝头;中间丝头(DNA结合)区
    2. NM_010277.3NP_034407.2号胶质纤维酸性蛋白亚型2

      参见NP_034407.2的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      描述
      转录变体:与变体1相比,该变体(2)在3'编码区和3'UTR上有所不同,这导致与亚型1相比,蛋白质(亚型2)的C末端更短且不同。
      源序列
      AI835063、AK079577、BC139357、BE651678、CX223233
      共识CDS
      CCDS25507.1号文件
      UniProtKB/Swiss-Prot公司
      A1E2H7型,A2AH87型,B2RTI7公司,P03995号,Q09J71型,第3季度USS4,1964年第4季度,问题496S3,Q7TQ30问题,Q80VX6型,Q925K2型,Q925K3型
      相关的
      ENSMUSP00000064691.4号,恩斯穆斯特00000067444.10
      保守领域(2)总结
      pfam00038型
      地点:65373
      长丝;中间丝蛋白
      pfam04732型
      地点:463
      灯丝头;中间丝头(DNA结合)区

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000077.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      102778162..102791368补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)

    mRNA和蛋白质

    1. XM_030245571.2号XP_030101431.1号胶质纤维酸性蛋白亚型X1

      保守领域(2)总结
      pfam00038型
      地点:65373
      长丝;中间丝蛋白
      pfam04732型
      地点:463
      灯丝头;中间丝头(DNA结合)区

    核糖核酸

    1. XR_388347.5号RNA序列