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    Krt5(Krt5)角蛋白5[小家鼠(家鼠)]

    基因ID:110308,更新日期2024年3月26日

    总结

    官方符号
    Krt5(Krt5)由提供MGI公司
    官方全名
    角蛋白5由提供MGI公司
    主要来源
    管理层:管理层:96702
    请参阅相关
    乐团:ENSMUSG00000061527 联盟基因组:MGI:96702
    基因类型
    蛋白质编码
    RefSeq状态
    已验证
    有机体
    小家鼠
    血统
    真核生物;后生动物;脊索动物;克兰亚塔;脊椎动物;真造口术;哺乳动物;Eutheria;尤阿古托格利尔斯;闪光;啮齿动物;肌形态;鼠形目;鼠科;穆里奈;穆斯;穆斯
    也称为
    K5;CK5;Tfip8;Krt2-5;3300001P10瑞克
    总结
    预测可实现支架蛋白结合活性。位于角蛋白丝和质膜中。以多种结构表达,包括消化系统;上皮;泌尿生殖系统;表皮系统;和感觉器官。用于研究Dowling-Meara型单纯性大疱性表皮松解症。与Dowling-Degos病相关的该基因的人类同源基因;单纯大疱性表皮松解症;单纯性大疱性表皮松解症伴斑点色素沉着。与人类KRT5同源(角蛋白5)。【由基因组资源联盟提供,2022年4月】
    表达式
    膀胱成人(RPKM 193.4)、肢体E14.5(RPKM123.9)和6个其他组织中的偏倚表达查看更多
    直系同源
    新款
    尝试新的基因表
    尝试新的成绩单表

    基因组背景

    参见中的Krt5基因组数据查看器
    位置:
    15层;15 56.98立方厘米
    外显子计数:
    9
    注释发布 状态 装配 Chr公司 位置
    RS_2024_02号 现在的 GRCm39型(GCF_000001635.27号) 15 NC_000081.7(101615504..101621340,补码)
    108.20200622 上一个程序集 GRCm38.p6型(GCF_000001635.26号) 15 NC_000081.6(101707069..101712905,补遗)

    染色体15-NC_000081.7描述邻近基因的基因组背景 Neighboring gene keratin 6B Neighboring gene predicted gene, 49428 Neighboring gene keratin 6A Neighboring gene STARR-seq mESC enhancer starr_39802 Neighboring gene keratin 71 Neighboring gene keratin 74

    基因组区域、转录物和产物

    表达式

    • 项目名称:鼠标ENCODE转录组数据
    • 描述:鼠标ENCODE项目生成的RNA分析数据集。
    • 生物项目:PRJNA66167型
    • 出版物:PMID 25409824
    • 分析日期:无

    参考文献

    PubMed中的相关文章

    GeneRIFs:功能的基因引用

    什么是GeneRIF?

    变更

    等位基因

    这类等位基因在《小鼠基因组信息学》上有记载(MGI)
    • 目标(4)1条引文
    • 核酸内切酶介导(7)

    互动

    产品 交互作用剂 其他基因 复杂 来源 酒吧 描述

    一般基因信息

    标记

    基因本体论 由MGI提供

    功能 证据代码 酒吧
    实现蛋白质结合 IPI公司
    从物理相互作用推断
    更多信息
    公共医学 
    使支架蛋白结合 国际标准化组织
    从序列正畸学推断
    更多信息
     
    使皮肤表皮的结构成分 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    过程 证据代码 酒吧
    涉及中间纤维组织 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    牵涉到中间纤维聚合 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与角化 国际律师协会
    从祖先的生物学角度推断
    更多信息
     
    参与细胞迁移的调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与蛋白质定位的调控 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 
    参与对机械刺激的反应 进口
    根据突变表型推断
    更多信息
    公共医学 

    一般蛋白质信息

    首选名称
    角蛋白,II型细胞骨架5
    姓名
    58kDa细胞角蛋白
    细胞角蛋白5
    角蛋白复合物2,碱性,基因5
    凝集素相互作用蛋白8
    Ⅱ型角蛋白Kb5

    NCBI参考序列(RefSeq)

    新款 尝试新的成绩单表

    独立于注释的RefSeq维护基因组

    这些参考序列独立于基因组构建而存在。解释

    这些参考序列独立于基因组进行筛选注释循环,因此其版本可能与当前的RefSeq版本不匹配基因组构建。通过比较中RefSeq的版本来确定版本不匹配本节至中报告的那一节基因组区域,成绩单和产品以上。

    mRNA和蛋白质

    1. NM_027011.3号NP_081287.1号角蛋白,II型细胞骨架5

      参见NP_081287.1的相同蛋白质及其注释位置

      状态:已验证

      源序列
      AC104862、AC120787
      共识CDS
      CCDS27861.1号文件
      UniProtKB/瑞士Prot
      Q920F2号,Q922U2型
      UniProtKB/TrEMBL公司
      Q32P04问题
      相关的
      ENSMUSP000000023709.6,ENSMUST00000023709.7
      保守领域(3)总结
      pfam00038型
      位置:161474
      长丝;中间丝蛋白
      pfam16208型
      位置:16158
      角蛋白2_head;角蛋白II型头部
      cl01888号
      位置:387447
      DUF883;功能未知的细菌蛋白(DUF883)

    注释基因组的参考序列:GCF_000001635.27-RS_2024_02

    以下部分包含属于特定基因组构建。解释

    参考GRCm39 C57BL/6J

    基因组学

    1. NC_000081.7参考GRCm39 C57BL/6J

      范围
      101615504..101621340补码
      下载
      GenBank(基因银行),美国金融服务贸易协会,序列查看器(图形)